概括?
基因 2770
象征 GNAI1
同义词 Gi
描述 G蛋白亚基Alpha I1
参考 MIM:139310|HGNC:HGNC:4384|Ensembl:ENSG00000127955|HPRD:00756|Vega:Otthumg0000000023523
基因type protein-coding
地图位置 7q21
Pascal P值 0.003
Sherlock P值 0.005
Fetal beta 0.448
eGene 尾状基底神经节
小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 canabinoid
G-PROTEIN RELAY
5-羟色胺
Potential synaptic genes

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 1.2615

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS6040607 CHR20 11371092 GNAI1 2770 0.14 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TP53I13 0.76 0.76
RFXANK 0.74 0.69
CAPG 0.74 0.67
AKR7A2 0.72 0.66
TMEM149 0.72 0.68
TIMP1 0.70 0.72
Clic1 0.69 0.63
TMEM179B 0.69 0.67
TMEM216 0.69 0.50
AL031319.2 0.69 0.56
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXW7 -0.50 -0.61
AL031003.1 -0.47 -0.56
RAB11FIP4 -0.47 -0.57
TRIM44 -0.46 -0.54
ERC2 -0.45 -0.58
SCN2A -0.45 -0.59
kif3a -0.45 -0.57
STXBP5 -0.44 -0.56
DNAJC6 -0.44 -0.56
MADD -0.44 -0.56

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004871 signal transducer activity IEA -
去:0003924 GTPase活性 塔斯 2834384
GO:0005515 protein binding 新闻学会 15537540
GO:0005525 GTP结合 IEA -
去:0019001 guanyl nucleotide binding IEA -
生物过程 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去:0007165 signal transduction IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0005834 heterotrimeric G-protein complex 塔斯 3110783
GO:0005886 质膜 塔斯 3139448

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ADCY5 AC5 adenylate cyclase 5 - HPRD,Biogrid 9748257
ADRA2A ADRA2 | ADRA2R | ADRAR | ALPHA2AAR | ZNF32 肾上腺素,α-2A-,受体 - HPRD 11732925
CD47 IAP |mer6 |OA3 CD47分子 - HPRD 11306274
CNR1 CANN6 | CB-R | CB1 | CB1A | CB1K5 | CB1R | CNR 大麻素受体1(脑) - HPRD,Biogrid 11168387
CRHR1 CRF-R |CRF1 |CRFR1 |CRH-R1H |CRHR |CRHR1F corticotropin releasing hormone receptor 1 - HPRD,Biogrid 10598591
DRD3 D3DR |ETM1 |FET1 |MGC149204 |MGC149205 多巴胺受体D3 - HPRD 10978845
epor MGC138358 erythropoietin receptor Reconstituted Complex BioGRID 12538595
FFAR1 FFA1R | GPCR40 | GPR40 free fatty acid receptor 1 - HPRD,Biogrid 12496284|12629551
GPR1 - G protein-coupled receptor 1 - HPRD 14530282
GPR143 OA1 G protein-coupled receptor 143 - HPRD,Biogrid 10471510
GPSM1 AGS3 |DKFZP727I051 G-protein signaling modulator 1 (AGS3-like, C. elegans) Reconstituted Complex BioGRID 14530282
GPSM2 LGN | Pins G蛋白信号调节剂2(类似AGS3,秀丽隐杆线虫) LGN interacts with Galphai1. BIND 15537540
GPSM3 C6orf9 |G18 |G18.1A |g18.1b |G18.2 |NG1 G蛋白信号调节剂3(类似AGS3,秀丽隐杆线虫) - HPRD,Biogrid 14656218
HRH4 AXOR35 | BG26 | GPCR105 | GPRv53 | H4 | H4R | HH4R | MGC133027 组胺受体H4 - HPRD 10973974
HTR2A 5-HT2A | HTR2 5-羟色胺(5-羟色胺)受体2A - HPRD 11916537
IGF1R CD221 | IGFIR | JTK13 | MGC142170 | MGC142172 | MGC18216 胰岛素样生长因子1受体 - HPRD,Biogrid 10644671
NGB - 神经白蛋白 Reconstituted Complex BioGRID 12860983
numa1 numa 核有丝分裂设备蛋白1 Numa与Galphai1相互作用。 BIND 15537540
OPRM1 KIAA0403 | MOR | MOR1 | OPRM 阿片受体,MU 1 - HPRD,Biogrid 12068084
rasd1 AGS1 |dexras1 |MGC:26290 RAS, dexamethasone-induced 1 in vitro
Reconstituted Complex
BioGRID 10840027|11842095
RGS10 - G蛋白信号传导的调节剂10 - HPRD,Biogrid 9207071
RGS12 DKFZP761K1617 |DKFZP761K1817 G蛋白信号传导的调节剂12 - HPRD,Biogrid 11387333
RGS14 - G蛋白信号的调节剂14 - HPRD,Biogrid 11387333|11976690
RGS16 A28-RGS14 | A28-RGS14P | RGS-R G蛋白信号的调节剂16 Biochemical Activity BioGRID 10878019
RGS18 RGS13 G蛋白信号传导的调节剂18 - HPRD,Biogrid 11955952
RGS19 GAIP | RGSGAIP G蛋白信号传导调节器19 - HPRD,Biogrid 8986788|10364213
RGS4 DKFZp761F1924 | MGC2124 | MGC60244 | RGP4 | SCZD9 G蛋白信号传导的调节剂4 - HPRD,Biogrid 9660808|11507164
RGS5 MST092 | MST106 | MST129 | MSTP032 | MSTP092 | MSTP106 | MSTP129 G蛋白信号传导的调节剂5 Affinity Capture-Western BioGRID 11253162
RGS7 - G蛋白信号传导的调节剂7 - HPRD,Biogrid 9572280
RIC8A MGC104517 |MGC131931 |MGC148073 |MGC148074 |ric8 |Synembryn resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans) - HPRD,Biogrid 12509430
S1PR1 Chedg1 |D1S3362 |ECGF1 |EDG-1 |EDG1 |FLJ58121 |S1P1 鞘氨醇1-磷酸受体1 - HPRD,Biogrid 8626678
S1PR2 AGR16 |EDG-5 |EDG5 |GPCR13 |H218 |LPB2 |S1P2 鞘氨醇1-磷酸受体2 - HPRD 10488065
S1pr3 EDG-3 |EDG3 |FLJ37523 |FLJ93220 |LPB3 |MGC71696 |S13 鞘氨醇1-磷酸受体3 - HPRD 10488065
S1PR5 EDG8 |EDG-8 |S1P5 |SPPR-1 |SPPR-2 鞘氨醇1-磷酸受体5 - HPRD 11069896
SSTR2 - 生长抑素受体2 - HPRD,Biogrid 7914078
SSTR3 - 生长抑素受体3 - HPRD,Biogrid 8183236
STRN MGC125642 | SG2NA 纹状体,钙调蛋白结合蛋白 - HPRD 15569929


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG AXON GUIDANCE 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg间隙交界处 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LEUKOCYTE TRANSENDOTHELIAL MIGRATION 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LONG TERM DEPRESSION 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SPPA PATHWAY 22 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BIOPEPTIDES PATHWAY 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CXCR4 PATHWAY 24 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MPR PATHWAY 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GSK3 PATHWAY 27 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EDG1 PATHWAY 27 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GPCR PATHWAY 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PAR1途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST ADRENERGIC 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Myocyte广告路径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER非原始组途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P3 PATHWAY 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P4途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P1途径 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1受体近端途径 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P META PATHWAY 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid ar nongenomic途径 31 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID刺猬Gli途径 48 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR3途径 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P2途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME施暴者ION OF ENERGY METABOLISM 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME OPIOID SIGNALLING 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADENYLATE CYCLASE INHIBITORY PATHWAY 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEUROTRANSMITTER RECEPTOR BINDING AND DOWNSTREAM TRANSMISSION IN THE POSTSYNAPTIC CELL 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PLC Beta介导的事件 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G PROTEIN ACTIVATION 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INHIBITION OF INSULIN SECRETION BY ADRENALINE NORADRENALINE 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA S SIGNALLING EVENTS 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Z SIGNALLING EVENTS 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL AMPLIFICATION 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADP SIGNALLING THROUGH P2RY12 21 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GABA B RECEPTOR ACTIVATION 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr的Takeda目标 85 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1感染 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL UP 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA UP 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS UP 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST PRENEOPLASTIC DN 55 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU ANGIOGENESIS DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂由Docetacel 4NM DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIEN BREAST CARCINOMA METAPLASTIC VS DUCTAL UP 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO BEXAROTENE DN 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2 TARGETS DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NADLER OBESITY DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D4 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C0 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZKI TUMOR INVASIVENESS 3D UP 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE RECENT THYMIC EMIGRANT 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS信号传导DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 10 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML WITH EVI1 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASGHARZADEH NEUROBLASTOMA POOR SURVIVAL DN 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S2 115 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILANGES SERUM SENSITIVE VIA TSC1 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kohoutek CCNT2目标 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-124/506 1678年 1684年 m8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
hsa-miR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-181 88 94 1a hsa-miR-181a aacauucaacgcugucggugagu
hsa-miR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
hsa-miR-181c aacauucaaccugucggugagu
hsa-miR-181d aacauucauuguugucggggguggguu
mir-19 549 555 1a hsa-miR-19a ugugcaaauaugauaugaaaacuga
hsa-miR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-218 1816年 1822年 m8 HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
miR-320 426 433 1a,m8 HSA-MIR-320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
mir-384 478 484 1a hsa-miR-384 AUUCCUAGAAAUUGUUCAUA
miR-448 265 272 1a,m8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-485-3p 1748年 1755年 1a,m8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu