基因页：GNAO1
概括？
| 基因 | 2775 |
| 象征 | GNAO1 |
| 同义词 | eiee17 | g-alpha-o | gnao |
| 描述 | G蛋白亚基Alpha O1 |
| 参考 | MIM：139311|HGNC：HGNC：4389|ENSEMBL：ENSG00000087258|HPRD：00757|Vega：Otthumg00000133241 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16Q13 |
| Pascal P值 | 0.224 |
| Sherlock P值 | 0.003 |
| TADA P值 | 0.011 |
| 胎儿β | -0.889 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | G蛋白继电器 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2CDB.HUMAN_MGLUR5 g2cdb.human_synaptosom G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.4488 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GNAO1 | CHR16 | 56370728 | G | 一个 | NM_020988 NM_138736 |
p.227a> t p.227a> t |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：XU_2012 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13936125 | 16 | 56225599 | GNAO1 | -0.023 | 0.25 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | GNAO1 | 2775 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
| 去：0003924 | GTPase活性 | 塔斯 | 1899283 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 去：0019001 | 圭烷核苷酸结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007212 | 多巴胺受体信号通路 | IEA | 多巴胺（GO期限：8） | - |
| 去：0009987 | 细胞过程 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0008016 | 心脏收缩的调节 | IEA | - | |
| 去：0007626 | 运动行为 | IEA | - | |
| 去：0006936 | 肌肉收缩 | 塔斯 | 9050846 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| adora1 | RDC7 | 腺苷A1受体 | - | HPRD | 10521440 |
| adra2a | adra2 |adra2r |Adrar |alpha2aar |Znf32 | 肾上腺素，α-2A-，受体 | - | HPRD | 7887906|11732925 |
| ADRA2C | adra2l2 |adra2rl2 |adrarl2 |alpha2car | 肾上腺素，α-2C-，受体 | - | HPRD | 1349607 |
| cacna1b | Biii |cacnl1a5 |Cacnn |cav2.2 | 钙通道，电压依赖性，n型，alpha 1b亚基 | 重构的复合物 | Biogrid | 11395521 |
| CRHR1 | CRF-R |CRF1 |CRFR1 |CRH-R1H |CRHR |CRHR1F | 皮质激素释放激素受体1 | - | HPRD，Biogrid | 10598591 |
| DCTN2 | DCTN50 |元素|RBP50 | Dynactin 2（P50） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| FFAR2 | ffa2r |GPR43 | 游离脂肪酸受体2 | - | HPRD | 12711604 |
| GPSM2 | lgn |别针 | G蛋白信号调节剂2（类似AGS3，秀丽隐杆线虫） | - | HPRD | 12925752 |
| HRH4 | Axor35 |BG26 |GPCR105 |gprv53 |H4 |H4R |HH4R |MGC133027 | 组胺受体H4 | - | HPRD | 10973974 |
| htr1f | 5-HT1F |5HT6 |htr1el |MR77 | 5-羟色胺（5-羟色胺）受体1F | - | HPRD | 11916537 |
| NGB | - | 神经白蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 12860983 |
| OPRD1 | OPRD | 阿片受体，三角洲1 | - | HPRD，Biogrid | 8393523 |
| OPRM1 | KIAA0403 |Mor |MOR1 |OPRM | 阿片受体，MU 1 | - | HPRD，Biogrid | 8393523 |
| ptpru | FLJ37530 |FMI |glepp1 |PCP-2 |PTP |PTP-J |ptp-pi |ptppsi |PTPRO |PTPU2 | R-PTP-PSI | hPTP-J | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，U | - | HPRD | 10196137 |
| RGS14 | - | G蛋白信号的调节剂14 | - | HPRD | 10926822 |
| RGS16 | A28-RGS14 |A28-RGS14P |RGS-R | G蛋白信号的调节剂16 | 重构的复合物 | Biogrid | 9079700 |
| RGS19 | Gaip |RGSGAIP | G蛋白信号传导调节器19 | - | HPRD，Biogrid | 8986788 |
| RGS4 | DKFZP761F1924 |MGC2124 |MGC60244 |RGP4 |SCZD9 | G蛋白信号传导的调节剂4 | - | HPRD，Biogrid | 9660808 |
| RGS5 | MST092 |MST106 |MST129 |MSTP032 |MSTP092 |MSTP106 |MSTP129 | G蛋白信号传导的调节剂5 | - | HPRD，Biogrid | 9079700 |
| RGS7 | - | G蛋白信号传导的调节剂7 | - | HPRD，Biogrid | 9572280 |
| RIC8A | MGC104517 |MGC131931 |MGC148073 |MGC148074 |ric8 |Synembryn | 对胆碱酯酶抑制剂8同源物A（秀丽隐杆线虫）的抗性 | - | HPRD，Biogrid | 12509430 |
| S1PR5 | EDG8 |EDG-8 |S1P5 |SPPR-1 |SPPR-2 | 鞘氨醇1-磷酸受体5 | - | HPRD | 11069896 |
| SCN8A | ceriii |医学|nach6 |NAV1.6 |PN4 | 钠通道，电压门，VIII型，α亚基 | - | HPRD，Biogrid | 10066808 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID内皮素路径 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID溶物磷脂途径 | 66 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ER非原始组途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID S1P S13途径 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID S1P S1P4途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID S1P S1P1途径 | 21 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID S1P META途径 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid ar nongenomic途径 | 31 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID刺猬Gli途径 | 48 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CXCR3途径 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID凝血酶PAR1途径 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID S1P S1P2途径 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome阿片类药物信号传导 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome PLC Beta介导的事件 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G蛋白激活 | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组抑制肾上腺素去肾上腺素的胰岛素分泌 | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roylance乳腺癌16Q副本编号DN | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roversi Glioma副本编号DN | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高与低DN | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MA髓样分化DN | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Delta FOSB目标8WK | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kamminga衰老 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ikeda mir30目标 | 116 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 934 | 940 | 1a | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-129-5p | 993 | 999 | 1a | HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc |
| HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||
| mir-134 | 1142 | 1149 | 1A，M8 | HSA-MIR-134脑 | ugugacuggugaccagaggg |
| mir-139 | 175 | 181 | 1a | HSA-MIR-139脑 | ucuacagugcacgugucu |
| HSA-MIR-139脑 | ucuacagugcacgugucu | ||||
| mir-181 | 1013 | 1019 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-203.1 | 1152 | 1158 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
| mir-218 | 569 | 575 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-30-5p | 1021 | 1028 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-326 | 138 | 144 | M8 | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
| mir-330 | 244 | 250 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-539 | 234 | 241 | 1A，M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |