基因页：got2
概括？
| 基因 | 2806 |
| 象征 | got2 |
| 同义词 | kat4 | kativ | mitaat |
| 描述 | 谷氨酸 - 奥恶麦转氨酶2 |
| 参考 | MIM：138150|HGNC：HGNC：4433|ENSEMBL：ENSG00000125166|HPRD：00684|Vega：Otthumg00000133769 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16Q21 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| Sherlock P值 | 0.126 |
| 胎儿β | -0.971 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA G2CDB.HUMANNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08251776 | 16 | 58767249 | got2 | 2.03e-8 | -0.019 | 7.02E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| khdrbs3 | 0.81 | 0.87 |
| VTA1 | 0.80 | 0.83 |
| ARMCX1 | 0.80 | 0.83 |
| RFWD2 | 0.80 | 0.82 |
| PPAPR5 | 0.80 | 0.86 |
| TMEM50A | 0.79 | 0.79 |
| Nell2 | 0.79 | 0.85 |
| ppp3cc | 0.79 | 0.81 |
| ASNSD1 | 0.79 | 0.79 |
| polr2b | 0.78 | 0.80 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PAQR6 | -0.66 | -0.77 |
| MT-CO2 | -0.66 | -0.71 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.71 |
| FXYD1 | -0.65 | -0.73 |
| HSD17B14 | -0.65 | -0.72 |
| S100B | -0.65 | -0.72 |
| hepn1 | -0.64 | -0.69 |
| HLA-F | -0.64 | -0.70 |
| AF347015.26 | -0.64 | -0.72 |
| TSC22D4 | -0.63 | -0.72 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004069 | 天冬氨酸转氨酶活性 | 经验 | 谷氨酸（GO期限：6） | 4052435 |
| 去：0004069 | 天冬氨酸转氨酶活性 | 艾达 | 谷氨酸（GO期限：6） | 2182221|2567216|2731362 |
| 去：0030170 | 吡啶还毒素结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006520 | 氨基酸代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006533 | 天冬氨酸分解代谢过程 | 艾达 | 2567216 | |
| 去：0009058 | 生物合成过程 | IEA | - | |
| GO：0015908 | 脂肪酸转运 | IEP | 9537447 | |
| GO：0045471 | 对乙醇的反应 | 艾达 | 9537447 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005739 | 线粒体 | 艾达 | 9537447 | |
| 去：0005743 | 线粒体内膜 | IEA | - | |
| 去：0005759 | 线粒体基质 | 经验 | 4052435 | |
| 去：0005759 | 线粒体基质 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 9537447 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg丙氨酸天冬氨酸和谷氨酸代谢 | 32 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg半胱氨酸和蛋氨酸代谢 | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 | 54 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg酪氨酸代谢 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG苯丙氨酸代谢 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组糖异生 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome氨基酸合成和互转换跨跨 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组葡萄糖代谢 | 69 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roylance乳腺癌16Q复制号码 | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AIYAR COBRA1靶向DN | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 | 87 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 | 77 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 戴尔基癌俯卧反应BPA | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-30-5p | 255 | 261 | 1a | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||