基因页:GP9
概括?
基因 | 2815 |
象征 | GP9 |
同义词 | CD42A | GPIX |
描述 | 糖蛋白IX血小板 |
参考 | MIM:173515|HGNC:HGNC:4444|ENSEMBL:ENSG00000169704|HPRD:01432|Vega:Otthumg00000159944 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q21.3 |
Pascal P值 | 0.583 |
胎儿β | 0.172 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21330071 | 3 | 128779277 | GP9 | 4.653E-4 | 0.254 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS843350 | CHR3 | 183946273 | GP9 | 2815 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG造血细胞谱系 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组血小板粘附于暴露的胶原蛋白 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纤维蛋白凝块凝结级联反应组的形成 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板聚集插头组 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome内在途径 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tenedini Megakaryocyte标记 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavor Cebpa靶向DN | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇7 | 118 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hecker IFNB1目标 | 95 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |