基因页：gpm6a
概括？
| 基因 | 2823 |
| 象征 | gpm6a |
| 同义词 | gpm6 | m6a |
| 描述 | 糖蛋白M6A |
| 参考 | MIM：601275|HGNC：HGNC：4460|Ensembl：ENSG00000150625|HPRD：03174|Vega：Otthumg00000160760 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q34 |
| Pascal P值 | 7.289E-6 |
| Sherlock P值 | 0.618 |
| 胎儿β | 0.245 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1106568 | CHR4 | 176861301 | Ag | 1.145e-8 | 内含子 | gpm6a |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7372527 | 0 | gpm6a | 2823 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| lims2 | 0.81 | 0.77 |
| RHBDF1 | 0.81 | 0.82 |
| 乍得 | 0.75 | 0.83 |
| SLC7A10 | 0.73 | 0.75 |
| olig1 | 0.72 | 0.85 |
| MMD2 | 0.71 | 0.79 |
| CSPG4 | 0.71 | 0.65 |
| rin3 | 0.71 | 0.84 |
| DOCK6 | 0.70 | 0.66 |
| neu4 | 0.70 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KLHDC2 | -0.61 | -0.65 |
| COQ3 | -0.60 | -0.74 |
| setd4 | -0.58 | -0.67 |
| 法尔斯布 | -0.57 | -0.68 |
| ube2d2 | -0.57 | -0.63 |
| FRG1 | -0.56 | -0.76 |
| ASNSD1 | -0.56 | -0.73 |
| TSG101 | -0.56 | -0.73 |
| polb | -0.56 | -0.78 |
| SUPV3L1 | -0.56 | -0.72 |
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 12493773 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合的Begum目标 | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦克拉克兰牙齿龋齿DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Pten的目标 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-133 | 1246 | 1252 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-148/152 | 1386 | 1393 | 1A，M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-181 | 1108 | 1114 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| MiR-200BC/429 | 1675年 | 1681年 | 1a | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac | ||||
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac | ||||
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| mir-204/211 | 433 | 439 | M8 | HSA-MIR-204脑 | Uucccuuugucauccuaugccu |
| HSA-MIR-211 | uucccuuugucauccuucgccu | ||||
| mir-205 | 892 | 898 | M8 | HSA-MIR-205 | uccuucauucccggagucug |
| mir-217 | 1649年 | 1656年 | 1A，M8 | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
| mir-218 | 914 | 920 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-221/222 | 1835年 | 1841年 | 1a | HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
| HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
| mir-28 | 208 | 215 | 1A，M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
| mir-323 | 868 | 874 | M8 | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
| mir-328 | 50 | 56 | M8 | HSA-MIR-328脑 | cuggcccucugccuuccgu |
| mir-330 | 1830年 | 1836年 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-365 | 1842年 | 1848年 | 1a | HSA-MIR-365 | uaaugccccuaaaaaauccuuau |
| mir-369-3p | 1702 | 1708年 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
| mir-374 | 1702 | 1708年 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
| mir-376c | 1055 | 1061 | M8 | HSA-MIR-376C | aacauagaggaaauuccacg |
| mir-409-5p | 423 | 429 | M8 | HSA-MIR-409-5P | Agguacccgagaacuuugca |
| mir-448 | 1647年 | 1653年 | M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| mir-485-3p | 996 | 1002 | M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |
| mir-493-5p | 1465 | 1471 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-495 | 617 | 623 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
| HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu | ||||
| mir-500 | 562 | 569 | 1A，M8 | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |
| mir-96 | 1874年 | 1880年 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |