基因页：gpm6b
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| 基因 | 2824 |
| 象征 | gpm6b |
| Synonyms | M6B |
| Description | 糖蛋白M6b |
| Reference | MIM:300051|HGNC:HGNC:4461|Ensembl:ENSG00000046653|HPRD：02082|Vega：Otthumg00000021162 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | Xp22.2 |
| Sherlock p-value | 0.002 |
| DEG P值 | DEG:Zhao_2015:p=5.77e-04:q=0.0926 |
| 胎儿β | -1.133 |
| 支持 | CELL ADHESION AND TRANSSYNAPTIC SIGNALING 潜在的突触基因 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG:Zhao_2015 | RNA Sequencing analysis | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
No co-expressed genes in brain regions
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | nervous system development | nas | 神经突（GO期限：5） | 8661015 |
| 去：0007275 | multicellular organismal development | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | nucleus | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0016020 | membrane | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | nas | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 757 | 764 | 1A，M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-124/506 | 757 | 763 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124brain | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| miR-135 | 1115 | 1121 | M8 | HSA-MIR-135A | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-141/200a | 866 | 872 | 1a | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg | ||||
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg | ||||
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| miR-155 | 1728年 | 1735 | 1A，M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
| mir-186 | 176 | 182 | 1a | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
| miR-194 | 1821年 | 1827年 | 1a | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
| mir-217 | 64 | 70 | 1a | hsa-miR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
| mir-299-5p | 896 | 902 | 1a | hsa-miR-299-5p | ugguuuaccgucccacauacau |
| mir-30-5p | 926 | 932 | 1a | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| hsa-miR-30cbrain | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30dSZ | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30bSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir-376c | 1287 | 1293 | 1a | HSA-MIR-376C | aacauagaggaaauuccacg |
| HSA-MIR-376C | aacauagaggaaauuccacg | ||||
| miR-384 | 146 | 153 | 1A，M8 | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
| miR-496 | 1720年 | 1726年 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
| mir-96 | 1790 | 1796 | M8 | HSA-MIR-96brain | uuuggcacuagcacauuuuugc |