概括
基因 282974
象征 STK32C
同义词 pke | yank3
描述 丝氨酸/苏氨酸激酶32C
参考 HGNC:HGNC:21332|ENSEMBL:ENSG00000165752|HPRD:18119|Vega:Otthumg0000000019285
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q26.3
Pascal P值 0.41
Sherlock P值 0.429
胎儿β -1.486
DMG 2(#研究)
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03487

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24158028 10 134073307 STK32C 6.009E-4 0.322 0.05 DMG:Wockner_2014
CG08190979 10 134145188 STK32C 5.4e-8 -0.012 1.4e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1873504 Chr10 134002270 STK32C 282974 0.07 顺式
RS2035804 Chr10 134034378 STK32C 282974 0 顺式
RS2035804 Chr10 134034378 STK32C 282974 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和替代剪接 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标 79 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因