基因页:STK32C
概括?
基因 | 282974 |
象征 | STK32C |
同义词 | pke | yank3 |
描述 | 丝氨酸/苏氨酸激酶32C |
参考 | HGNC:HGNC:21332|ENSEMBL:ENSG00000165752|HPRD:18119|Vega:Otthumg0000000019285 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q26.3 |
Pascal P值 | 0.41 |
Sherlock P值 | 0.429 |
胎儿β | -1.486 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03487 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24158028 | 10 | 134073307 | STK32C | 6.009E-4 | 0.322 | 0.05 | DMG:Wockner_2014 |
CG08190979 | 10 | 134145188 | STK32C | 5.4e-8 | -0.012 | 1.4e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1873504 | Chr10 | 134002270 | STK32C | 282974 | 0.07 | 顺式 | ||
RS2035804 | Chr10 | 134034378 | STK32C | 282974 | 0 | 顺式 | ||
RS2035804 | Chr10 | 134034378 | STK32C | 282974 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/STK32C_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee转移和替代剪接 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |