基因页面:BLOC1S2
总结吗?
| GeneID | 282991年 |
| 象征 | BLOC1S2 |
| 同义词 | BLOS2 | BORCS2 | CEAP | CEAP11 |
| 描述 | 生物起源的溶酶体细胞器复杂1单元2 |
| 参考 | MIM: 609768|HGNC: HGNC: 20984|运用:ENSG00000196072|HPRD: 12526| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10 q24.31 |
| 帕斯卡假定值 | 1.497的军医 |
| 夏洛克假定值 | 0.995 |
| 胎儿β | 0.299 |
| eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10883450 | chr10 | 101923420 | BLOC1S2 | 282991年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs7358099 | chr10 | 101955001 | BLOC1S2 | 282991年 | 0.08 | 独联体 | ||
| rs17668159 | chr10 | 101998829 | BLOC1S2 | 282991年 | 0 | 独联体 | ||
| rs7073610 | chr10 | 102006624 | BLOC1S2 | 282991年 | 4.874的军医 | 独联体 | ||
| rs7924284 | chr10 | 102018088 | BLOC1S2 | 282991年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs6584356 | chr10 | 102050241 | BLOC1S2 | 282991年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs17668159 | chr10 | 101998829 | BLOC1S2 | 282991年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs7073610 | chr10 | 102006624 | BLOC1S2 | 282991年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs3808916 | 10 | 101947737 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 98732年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4917887 | 10 | 101950108 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 96361年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7358099 | 10 | 101955002 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 91467年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190421 | 10 | 101955612 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 90857年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6584350 | 10 | 101957215 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.676 e - | 0 | 89254年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7911057 | 10 | 101957369 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.68 e - | 0 | 89100年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7922090 | 10 | 101975269 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 71200年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs201666900 | 10 | 101976828 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 69641年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3831070 | 10 | 101980571 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 65898年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7093166 | 10 | 101980914 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 8.98 e-11 | 0 | 65555年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190430 | 10 | 101984545 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 61924年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs397800071 | 10 | 101984603 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 61866年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12247992 | 10 | 101985087 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 61382年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6584353 | 10 | 101987055 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 59414年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190431 | 10 | 101997490 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.399 e - | 0 | 48979年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3750709 | 10 | 101998052 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 48417年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12243800 | 10 | 102004155 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 4.186 e - | 0 | 42314年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2281949 | 10 | 102006402 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 40067年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7916126 | 10 | 102007373 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 39096年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7082753 | 10 | 102008483 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 37986年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs370254721 | 10 | 102009232 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.042 e-9 | 0 | 37237年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34537651 | 10 | 102009233 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 37236年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4919440 | 10 | 102014919 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 31550年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2270962 | 10 | 102016044 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 30425年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7924284 | 10 | 102018089 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 28380年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4919442 | 10 | 102020343 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.786 e - | 0 | 26126年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs66728174 | 10 | 102020626 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 25843年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190443 | 10 | 102023738 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 22731年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190444 | 10 | 102024352 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 22117年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs397746233 | 10 | 102025231 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.402 e - | 0 | 21238年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs397721414 | 10 | 102029432 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 17037年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs61166818 | 10 | 102032865 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.644 e - | 0 | 13604年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs398046205 | 10 | 102034062 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 2.814 e - | 0 | 12407年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12253275 | 10 | 102043477 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.555 e-8 | 0 | 2992年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71488053 | 10 | 102044312 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 5.208 e-11 | 0 | 2157年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1809105 | 10 | 102049061 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 4.644 e-8 | 0 | -2592年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2242053 | 10 | 102050347 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 3.929 e - | 0 | -3878年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2242052 | 10 | 102050514 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 4.778 e - | 0 | -4045年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs5787377 | 10 | 102050971 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.135 e-6 | 0 | -4502年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67755402 | 10 | 102050972 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.081 e-6 | 0 | -4503年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11427416 | 10 | 102050973 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.135 e-6 | 0 | -4504年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190456 | 10 | 102051763 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.369 e-8 | 0 | -5294年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12241379 | 10 | 102052373 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 1.369 e-8 | 0 | -5904年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11190457 | 10 | 102053720 | BLOC1S2 | ENSG00000196072.7 | 6.884 e-9 | 0 | -7251年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GHANDHI直接照射 | 110年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WARTERS反应红外皮肤 | 83年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WARTERS红外响应5 gy | 47 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |