概括
基因 2830
象征 GPR6
同义词 -
描述 G蛋白偶联受体6
参考 MIM:600553|HGNC:HGNC:4515|ENSEMBL:ENSG00000146360|HPRD:02775|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q21
Pascal P值 0.222
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID:COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6924963 CHR6 110838907 GPR6 2830 0.01 顺式
RS9386913 CHR6 110850514 GPR6 2830 0.12 顺式
RS17186508 CHR5 65194022 GPR6 2830 0.18 反式
RS1329778 CHR9 73755912 GPR6 2830 0.17 反式
RS16976379 CHR18 40198836 GPR6 2830 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Tollip 0.89 0.87
KCNK1 0.89 0.82
DNM1 0.89 0.88
extl1 0.89 0.84
CNTNAP1 0.89 0.89
faim2 0.89 0.90
MFSD4 0.89 0.88
TMEM130 0.88 0.89
Tyro3 0.88 0.82
mast3 0.88 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GTF3C6 -0.50 -0.47
pde9a -0.49 -0.53
Bcl7c -0.48 -0.55
RBMX2 -0.48 -0.56
C9orf46 -0.48 -0.51
Fam36a -0.48 -0.39
FADS2 -0.47 -0.42
traf4 -0.47 -0.53
tubb2b -0.47 -0.52
KIAA1949 -0.46 -0.41

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0001619 溶磷脂和溶血磷脂酸受体活性 IEA -
去:0004872 受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0007204 胞质钙离子浓度的升高 IEA -
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号传导途径 tas 7832990
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 tas 7832990

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2 DN 77 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger H3K27me3在癌症中的正常和甲基化 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27Me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML,带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1向上 125 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因