基因页:GPR6
概括?
基因 | 2830 |
象征 | GPR6 |
同义词 | - |
描述 | G蛋白偶联受体6 |
参考 | MIM:600553|HGNC:HGNC:4515|ENSEMBL:ENSG00000146360|HPRD:02775| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q21 |
Pascal P值 | 0.222 |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID:COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6924963 | CHR6 | 110838907 | GPR6 | 2830 | 0.01 | 顺式 | ||
RS9386913 | CHR6 | 110850514 | GPR6 | 2830 | 0.12 | 顺式 | ||
RS17186508 | CHR5 | 65194022 | GPR6 | 2830 | 0.18 | 反式 | ||
RS1329778 | CHR9 | 73755912 | GPR6 | 2830 | 0.17 | 反式 | ||
RS16976379 | CHR18 | 40198836 | GPR6 | 2830 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GPR6_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Tollip | 0.89 | 0.87 |
KCNK1 | 0.89 | 0.82 |
DNM1 | 0.89 | 0.88 |
extl1 | 0.89 | 0.84 |
CNTNAP1 | 0.89 | 0.89 |
faim2 | 0.89 | 0.90 |
MFSD4 | 0.89 | 0.88 |
TMEM130 | 0.88 | 0.89 |
Tyro3 | 0.88 | 0.82 |
mast3 | 0.88 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GTF3C6 | -0.50 | -0.47 |
pde9a | -0.49 | -0.53 |
Bcl7c | -0.48 | -0.55 |
RBMX2 | -0.48 | -0.56 |
C9orf46 | -0.48 | -0.51 |
Fam36a | -0.48 | -0.39 |
FADS2 | -0.47 | -0.42 |
traf4 | -0.47 | -0.53 |
tubb2b | -0.47 | -0.52 |
KIAA1949 | -0.46 | -0.41 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0001619 | 溶磷脂和溶血磷脂酸受体活性 | IEA | - | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
去:0007204 | 胞质钙离子浓度的升高 | IEA | - | |
去:0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号传导途径 | tas | 7832990 | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | tas | 7832990 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2 DN | 77 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlesinger H3K27me3在癌症中的正常和甲基化 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27Me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML,带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1向上 | 125 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |