基因页：CCDC88B
概括？
| 基因 | 283234 |
| 象征 | CCDC88B |
| 同义词 | brlz | ccdc88 | hkrp3 | gipie |
| 描述 | 包含88b |
| 参考 | MIM：611205|HGNC：HGNC：26757|ENSEMBL：ENSG00000168071|HPRD：10986|Vega：Otthumg0000000045419 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q12.3 |
| Pascal P值 | 0.234 |
| Sherlock P值 | 0.884 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08024887 | 11 | 64108241 | CCDC88B | 1.089E-4 | -0.409 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
| CG26107100 | 11 | 64112546 | CCDC88B | 2.604E-4 | 0.299 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17392743 | CHR1 | 54764240 | CCDC88B | 283234 | 0.15 | 反式 | ||
| RS2502827 | CHR1 | 176044216 | CCDC88B | 283234 | 0.03 | 反式 | ||
| RS17572651 | CHR1 | 218943612 | CCDC88B | 283234 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CCDC88B | 283234 | 1.577E-14 | 反式 | ||
| RS16858054 | CHR2 | 171105787 | CCDC88B | 283234 | 0.11 | 反式 | ||
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | CCDC88B | 283234 | 2.454e-4 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | CCDC88B | 283234 | 3.671E-8 | 反式 | ||
| RS17762315 | CHR5 | 76807576 | CCDC88B | 283234 | 0.01 | 反式 | ||
| RS7729096 | CHR5 | 76835927 | CCDC88B | 283234 | 0.08 | 反式 | ||
| RS11738579 | CHR5 | 95119841 | CCDC88B | 283234 | 0.18 | 反式 | ||
| RS16890367 | CHR6 | 38078448 | CCDC88B | 283234 | 0.09 | 反式 | ||
| RS3118341 | Chr9 | 25185518 | CCDC88B | 283234 | 0.12 | 反式 | ||
| RS11139334 | Chr9 | 84209393 | CCDC88B | 283234 | 7.845e-4 | 反式 | ||
| RS2766987 | Chr9 | 113667956 | CCDC88B | 283234 | 0.18 | 反式 | ||
| RS3765543 | Chr9 | 134458323 | CCDC88B | 283234 | 0.1 | 反式 | ||
| RS2393316 | Chr10 | 59333070 | CCDC88B | 283234 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CCDC88B | 283234 | 2.253e-25 | 反式 | ||
| RS1041786 | CHR21 | 22617710 | CCDC88B | 283234 | 4.193E-4 | 反式 | ||
| RS647152 | 11 | 64109118 | CCDC88B | ENSG00000168071.17 | 1.358E-6 | 0.02 | 1423 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS479552 | 11 | 64110683 | CCDC88B | ENSG00000168071.17 | 1.364E-6 | 0.02 | 2988 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lim乳腺腔祖先 | 58 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |