基因页:exoc3l1
概括?
基因 | 283849 |
象征 | exoc3l1 |
同义词 | exoc3l |
描述 | 外囊复合物分量3类样1 |
参考 | MIM:614117|HGNC:HGNC:27540|ENSEMBL:ENSG00000179044|HPRD:14148|Vega:Otthumg00000137508 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q22.1 |
Pascal P值 | 0.144 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG10947003 | 16 | 67218230 | exoc3l1 | 5.58e-10 | -0.016 | 8.9e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | exoc3l1 | 283849 | 0.02 | 反式 | ||
RS16878317 | CHR8 | 31657853 | exoc3l1 | 283849 | 0.14 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | exoc3l1 | 283849 | 8.59e-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EXOC3L1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 | 142 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |