概括
基因 283871
象征 PGP
同义词 PGPase
描述 磷酸甘氨酸磷酸酶
参考 MIM:172280|HGNC:HGNC:8909|Ensembl:ENSG00000184207|Vega:Otthumg00000177047
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p13.3
Pascal P值 0.744
胎儿β -1.611

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
去:0008967 磷酸甘氨酸磷酸酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001501 骨骼系统开发 IEA -
去:0005975 碳水化合物代谢过程 IEA -
去:0008152 代谢过程 IEA -
GO:0016331 胚胎上皮的形态发生 IEA -
GO:0042981 调节凋亡 IEA -
去:0030155 细胞粘附的调节 IEA -
GO:0042475 含牙齿的牙齿的牙生成 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG乙醛酸盐和二羧酸二羧酸盐代谢 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 363 369 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-137 1423 1429 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 201 207 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-30-5p 174 181 1A,M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-409-5p 290 297 1A,M8 HSA-MIR-409-5P Agguacccgagaacuuugca