基因页：C16orf54
概括？
| 基因 | 283897 |
| 象征 | C16orf54 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 染色体16开放阅读框54 |
| 参考 | HGNC：HGNC：26649|ENSEMBL：ENSG00000185905|HPRD：08183|Vega：Otthumg00000132116 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p11.2 |
| Pascal P值 | 0.284 |
| 胎儿β | 0.02 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamashita在前列腺癌中甲基化 | 57 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-338 | 829 | 835 | 1a | HSA-MIR-338脑 | uccagauuuuuguuga |