Summary
基因ID 284
Symbol ANGPT1
同义词 agp1 | agpt | ang1
描述 血管生成素1
参考 MIM:601667|HGNC:HGNC:484|ENSEMBL:ENSG00000154188|HPRD:03392|Vega:OTTHUMG00000164812
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q23.1
Pascal P值 0.021
胎儿β -0.504
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 2

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10958892 Chr9 10125117 ANGPT1 284 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NRXN1 0.91 0.94
ank3 0.90 0.93
KIAA1109 0.89 0.93
DOCK9 0.89 0.91
grlf1 0.89 0.91
夹子1 0.88 0.92
PPFIA2 0.88 0.92
LARP4B 0.88 0.92
Dync1H1 0.88 0.91
HGSNAT 0.87 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.69 -0.71
AF347015.31 -0.68 -0.73
MT-CO2 -0.67 -0.73
AC021016.1 -0.67 -0.74
higd1b -0.67 -0.75
AF347015.33 -0.65 -0.66
ACSF2 -0.65 -0.70
TLCD1 -0.64 -0.69
HSD17B14 -0.64 -0.69
AF347015.8 -0.64 -0.70

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005102 受体结合 IEA 神经递质(GO期限:4) -
去:0005102 受体结合 塔斯 神经递质(GO期限:4) 8980223|10766762
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001525 血管生成 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0007165 信号转导 塔斯 10766762
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 EXP 14665640|14749497
去:0005576 细胞外区域 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID血管生成素受体途径 50 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID SHP2途径 58 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Tie2信号传导 17 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组止血 466 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY DN 367 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
武田的目标NUP98 HOXA9融合3 d 182 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 55 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 All SZGR 2.0 genes in this pathway
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN 51 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hasina NOL7目标DN 13 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
galie肿瘤血管生成 8 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
hemin的addya红斑分化 73 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿比·lif信号2向上 14 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Radmacher AML预后 78 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Munshi多发性骨髓瘤 81 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL LONG TERM 302 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAYO AGING MUSCLE UP 244 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染18小时DN 178 121 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 50 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
外邦紫外线低剂量DN 67 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 All SZGR 2.0 genes in this pathway
de yy1靶向DN 92 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础 648 398 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞向上 260 174 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mizukami缺氧DN 6 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN 80 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN 882 538 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA分泌因素 344 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 1859年 1865年 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1859年 1865年 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-204/211 250 257 1A,M8 hsa-miR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
miR-496 343 350 1A,M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc