基因页面:GPR17
总结吗?
GeneID | 2840年 |
象征 | GPR17 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | G protein-coupled受体17 |
参考 | MIM: 603071|HGNC: HGNC: 4471|运用:ENSG00000144230|HPRD: 04351|织女:OTTHUMG00000131533 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2对方篮里 |
帕斯卡假定值 | 0.552 |
胎儿β | -2.222 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.023 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00755 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs2540862 | chr14 | 91700845 | GPR17 | 2840年 | 0.19 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GPR17_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
P2RY12 | 0.84 | 0.89 |
CD86 | 0.84 | 0.82 |
ADORA3 | 0.82 | 0.81 |
RGS10 | 0.81 | 0.85 |
C1QC | 0.81 | 0.81 |
TBXAS1 | 0.80 | 0.81 |
SAMSN1 | 0.80 | 0.84 |
C1QA | 0.79 | 0.77 |
RNASE6 | 0.79 | 0.79 |
LAPTM5 | 0.78 | 0.81 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HIP1R | -0.38 | -0.39 |
DMPK | -0.35 | -0.43 |
TNKS1BP1 | -0.35 | -0.33 |
SMTN | -0.35 | -0.48 |
SAFB2 | -0.34 | -0.31 |
CEP250 | -0.34 | -0.30 |
PABPN1 | -0.33 | -0.38 |
UPF3A | -0.33 | -0.40 |
SFRS16 | -0.33 | -0.33 |
UCP3 | -0.33 | -0.36 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004950 | 趋化因子受体的活动 | 助教 | 8558062 | |
去:0045028 | purinergic核苷酸受体活动,g蛋白耦合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007186 | g蛋白耦合受体蛋白信号通路 | 助教 | 8558062 | |
去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 8558062 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME胃泌激素分子通过PKC和MAPK信号通路 | 205年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GαQ信号事件 | 184年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME P2Y受体 | 12 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME核苷酸像PURINERGIC受体 | 16 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME类二十烷酸配体受体有约束力 | 16 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
我REACTOME Gα信号事件 | 195年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
哈里斯脑癌祖细胞 | 44 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TAVAZOIE转移 | 108年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VERHAAK胶质母细胞瘤颈板 | 177年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群3 DN | 42 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群5 DN | 50 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群6 DN | 38 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |