概括
基因 284654
象征 RSPO1
同义词 cristin3 | rspo
描述 R-Spondin 1
参考 MIM:609595|HGNC:HGNC:21679|ENSEMBL:ENSG00000169218|HPRD:08288|Vega:Otthumg00000004321
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p34.3
Pascal P值 0.351
胎儿β -0.174
DMG 1(#研究)
主持人 皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04862500 1 38099874 RSPO1 2.6e-8 -0.009 8.31E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
pid wnt信号通路 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高与低DN 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时DN 57 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta EBNA1反相关 173 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标组4 DN 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM糖蛋白 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因