基因页:MCHR1
概括?
基因 | 2847 |
象征 | MCHR1 |
同义词 | GPR24 | MCH-1R | MCH1R | SLC-1 | SLC1 |
描述 | 黑色素浓缩激素受体1 |
参考 | MIM:601751|HGNC:HGNC:4479|ENSEMBL:ENSG00000128285|HPRD:11874|Vega:Otthumg00000150256 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.2 |
Pascal P值 | 2.04e-5 |
Sherlock P值 | 0.88 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MCHR1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008188 | 神经肽受体活性 | 塔斯 | 神经递质(GO期限:8) | 10860944 |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0030273 | 黑色素浓缩激素受体活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质(GO期限:8) | - |
去:0007204 | 胞质钙离子浓度的升高 | 塔斯 | 10421367 | |
去:0007193 | G蛋白信号传导,腺苷酸环化酶抑制途径 | 塔斯 | 10421367 | |
去:0006091 | 产生前体代谢物和能量 | 塔斯 | 10421367 | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0007631 | 喂养行为 | 塔斯 | 10421367 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10421367 | |
GO:0031513 | 非运动原发性纤毛 | ISS | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2向上 | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 137 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-24 | 588 | 594 | M8 | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
mir-324-5p | 558 | 564 | 1a | HSA-MIR-324-5p | CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU |