概括
基因 2847
象征 MCHR1
同义词 GPR24 | MCH-1R | MCH1R | SLC-1 | SLC1
描述 黑色素浓缩激素受体1
参考 MIM:601751|HGNC:HGNC:4479|ENSEMBL:ENSG00000128285|HPRD:11874|Vega:Otthumg00000150256
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.2
Pascal P值 2.04e-5
Sherlock P值 0.88
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008188 神经肽受体活性 塔斯 神经递质(GO期限:8) 10860944
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0030273 黑色素浓缩激素受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007218 神经肽信号通路 IEA 神经递质(GO期限:8) -
去:0007204 胞质钙离子浓度的升高 塔斯 10421367
去:0007193 G蛋白信号传导,腺苷酸环化酶抑制途径 塔斯 10421367
去:0006091 产生前体代谢物和能量 塔斯 10421367
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0007631 喂养行为 塔斯 10421367
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10421367
GO:0031513 非运动原发性纤毛 ISS -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2向上 139 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-24 588 594 M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-324-5p 558 564 1a HSA-MIR-324-5p CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU