基因页面:TTC28-AS1
总结吗?
| GeneID | 284900年 |
| 象征 | TTC28-AS1 |
| 同义词 | TTC28-AS | TTC28AS | dJ353E16.2 |
| 描述 | TTC28反义RNA 1 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 29336|运用:ENSG00000235954| |
| 基因型 | ncRNA |
| 地图上的位置 | 22 q12.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.045 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2267127 | 22 | 28294801 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.264 e-6 | 0.02 | -20563年 | gtex_brain_ba24 |
| rs738454 | 22 | 28305509 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.486 e-6 | 0.02 | -9855年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1807581 | 22 | 28306070 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 3.42 e - | 0.02 | -9294年 | gtex_brain_ba24 |
| rs5762399 | 22 | 28306607 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 5.394 e - | 0.02 | -8757年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56156048 | 22 | 28312564 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.587 e-6 | 0.02 | -2800年 | gtex_brain_ba24 |
| rs9613545 | 22 | 28336162 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.264 e-6 | 0.02 | 20798年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2267127 | 22 | 28294801 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 6.567 e-8 | 0 | -20563年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs738454 | 22 | 28305509 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 5.474 e-8 | 0 | -9855年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1807581 | 22 | 28306070 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 3.966 e-8 | 0 | -9294年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs5762399 | 22 | 28306607 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.61 e - | 0 | -8757年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs56156048 | 22 | 28312564 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 5.65 e-8 | 0 | -2800年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7292046 | 22 | 28314113 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.478 e - | 0 | -1251年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16985722 | 22 | 28315465 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.084 e-9 | 0 | 101年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2267128 | 22 | 28316173 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.085 e-9 | 0 | 809年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12483793 | 22 | 28319511 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 3.643 e - | 0 | 4147年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12484349 | 22 | 28329949 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 2.017 e - | 0 | 14585年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9613545 | 22 | 28336162 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.023 e - | 0 | 20798年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2294818 | 22 | 28386322 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 6.977 e - | 0 | 70958年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78439401 | 22 | 28395314 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.351 e - | 0 | 79950年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16985863 | 22 | 28405165 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 6.754 e-8 | 0 | 89801年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8138623 | 22 | 28406672 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.257 e - | 0 | 91308年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78320689 | 22 | 28407763 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.232 e-8 | 0 | 92399年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs75650828 | 22 | 28415655 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.139 e - | 0 | 100291年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2076505 | 22 | 28424507 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 5.832 e - | 0 | 109143年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2235713 | 22 | 28430652 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.23 e - | 0 | 115288年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9613563 | 22 | 28433076 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 5.402 e-8 | 0 | 117712年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs79037983 | 22 | 28459665 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 9.751 e-8 | 0 | 144301年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8137183 | 22 | 28477312 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 2.785 e-8 | 0 | 161948年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs75503143 | 22 | 28510690 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.372 e-6 | 0 | 195326年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs135646 | 22 | 28541075 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 4.257 e-8 | 0 | 225711年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs5762511 | 22 | 28575543 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 2.047 e - | 0 | 260179年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs77242046 | 22 | 28613261 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 7.558 e - | 0 | 297897年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs134171 | 22 | 28613262 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 7.558 e - | 0 | 297898年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16986354 | 22 | 28754648 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.272 e-6 | 0 | 439284年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16986420 | 22 | 28827214 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.014 e-6 | 0 | 511850年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16986431 | 22 | 28837904 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.59 e-6 | 0 | 522540年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs74720230 | 22 | 28894879 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.516 e-6 | 0 | 579515年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs16986544 | 22 | 28995694 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 1.59 e-6 | 0 | 680330年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202162898 | 22 | 29017546 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 8.268 e - | 0 | 702182年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs76317571 | 22 | 29017547 | TTC28-AS1 | ENSG00000235954.2 | 9.296 e - | 0 | 702183年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 近藤EZH2的目标 | 245年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CERIBELLI基因不活跃和受NFY的约束 | 45 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |