概括
基因 284996
象征 RNF149
同义词 dnaptp2
描述 环手指蛋白149
参考 HGNC:HGNC:23137|ENSEMBL:ENSG00000163162|HPRD:11513|Vega:Otthumg00000130685
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q11.2
Pascal P值 0.013
Sherlock P值 1.172E-4
胎儿β 0.068
主持人 小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17004874 CHR4 81214574 RNF149 284996 0.04 反式
RS17109578 Chr10 90351347 RNF149 284996 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 艾达 18029348
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
王攀登目标DN 186 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
兰迪斯乳腺癌进展 44 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan终端末端芽 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制靶向DN 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ellwood Myc Targets DN 40 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-24* 743 749 M8 HSA-MIR-189 Gugccuacugagagauaucagu