基因页：rpusd3
概括？
| 基因 | 285367 |
| 象征 | rpusd3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | RNA伪苷酸合酶结构域，含3 |
| 参考 | HGNC：HGNC：28437|Ensembl：ENSG00000156990|HPRD：14532|Vega：Otthumg00000128441 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P25.3 |
| Pascal P值 | 0.415 |
| Sherlock P值 | 0.364 |
| 胎儿β | -0.805 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rpusd3 | CHR3 | 9881966 | C | t | NM_001142547 NM_173659 |
p.194r> q p.209r> q |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24596576 | 3 | 10067780 | rpusd3 | 4.897E-4 | 3.387 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG07614786 | 3 | 9860331 | rpusd3 | 0.001 | -3.555 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2040557 | Chr9 | 135765563 | rpusd3 | 285367 | 0.05 | 反式 | ||
| RS57223920 | 3 | 9885109 | rpusd3 | ENSG00000156990.10 | 5.96057E-8 | 0 | 1177 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2290306 | 3 | 9885615 | rpusd3 | ENSG00000156990.10 | 5.90942E-8 | 0 | 671 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS71314367 | 3 | 9888113 | rpusd3 | ENSG00000156990.10 | 5.76E-8 | 0 | -1827 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS17050606 | 3 | 9888685 | rpusd3 | ENSG00000156990.10 | 5.76432E-8 | 0 | -2399 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS140688906 | 3 | 9889917 | rpusd3 | ENSG00000156990.10 | 3.93558E-8 | 0 | -3631 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |