概括
基因 285800
象征 PRR18
同义词 -
描述 Proline Rich 18
参考 HGNC:HGNC:28574|ENSEMBL:ENSG00000176381|HPRD:17533|Vega:Otthumg00000167034
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q27
Pascal P值 0.25
Sherlock P值 0.619
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 3.70E-04:Q = 0.0924
胎儿β -2.573
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS651185 CHR1 233871029 PRR18 285800 0.08 反式
RS10229042 CHR7 11228259 PRR18 285800 0.13 反式
RS5003961 CHR7 78072443 PRR18 285800 0.06 反式
RS4515471 CHR7 78072585 PRR18 285800 0.06 反式
RS10259327 CHR7 78074924 PRR18 285800 0.06 反式
RS1844541 Chr10 106516231 PRR18 285800 0.18 反式
RS17137051 CHR16 4521748 PRR18 285800 0.08 反式
RS6632306 Chrx 35590460 PRR18 285800 0.05 反式
RS1935404 Chrx 35605181 PRR18 285800 0.08 反式
RS5942141 Chrx 91433860 PRR18 285800 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇2向上 54 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因