基因页面:XKR6
总结吗?
| GeneID | 286046年 |
| 象征 | XKR6 |
| 同义词 | C8orf21 | C8orf5 | C8orf7 | XRG6 |
| 描述 | XK相关6 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 27806|运用:ENSG00000171044|HPRD: 12926|织女:OTTHUMG00000129351 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 p23.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.007 |
| 胎儿β | 0.776 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| XKR6 | chr8 | 11058086 | T | C | NM_173683 NM_173683 |
。 p.255R > G |
splice-donor-ex2ag 错义 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17572651 | chr1 | 218943612 | XKR6 | 286046年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | XKR6 | 286046年 | 1.18 e-8 | 反式 | ||
| rs7584986 | chr2 | 184111432 | XKR6 | 286046年 | 5.424 e-6 | 反式 | ||
| rs9810143 | chr3 | 5060209 | XKR6 | 286046年 | 0.15 | 反式 | ||
| rs10491487 | chr5 | 80323367 | XKR6 | 286046年 | 0 | 反式 | ||
| rs11139334 | chr9 | 84209393 | XKR6 | 286046年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | XKR6 | 286046年 | 3.139 e-11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群6 DN | 38 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |