基因页：C9orf142
概括？
| 基因 | 286257 |
| 象征 | C9orf142 |
| 同义词 | paxx |
| 描述 | 染色体9开放阅读框142 |
| 参考 | MIM：616315|HGNC：HGNC：27849|ENSEMBL：ENSG00000148362|HPRD：14163|Vega：Otthumg00000020971 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9Q34.3 |
| Pascal P值 | 0.798 |
| 胎儿β | -0.088 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07078114 | 9 | 139606202 | C9orf142 | 7.574E-4 | 6.03 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1578978 | CHR8 | 118196802 | C9orf142 | 286257 | 0.08 | 反式 | ||
| RS7860430 | 9 | 139884447 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.25E-6 | 0 | -2423 | gtex_brain_ba24 |
| RS10870156 | 9 | 139885539 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 4.464e-7 | 0 | -1331 | gtex_brain_ba24 |
| RS10870157 | 9 | 139885762 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.147E-8 | 0 | -1108 | gtex_brain_ba24 |
| RS10870158 | 9 | 139885820 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 6.814e-8 | 0 | -1050 | gtex_brain_ba24 |
| RS10781530 | 9 | 139885948 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 6.812E-8 | 0 | -922 | gtex_brain_ba24 |
| RS10870159 | 9 | 139887042 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 7.771E-8 | 0 | 172 | gtex_brain_ba24 |
| RS7470867 | 9 | 139893123 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 7.036e-8 | 0 | 6253 | gtex_brain_ba24 |
| RS6560653 | 9 | 139894003 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.069e-8 | 0 | 7133 | gtex_brain_ba24 |
| RS7032381 | 9 | 139894331 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 5.626E-8 | 0 | 7461 | gtex_brain_ba24 |
| RS7022347 | 9 | 139894332 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.997E-8 | 0 | 7462 | gtex_brain_ba24 |
| RS12340777 | 9 | 139895429 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 4.096E-8 | 0 | 8559 | gtex_brain_ba24 |
| RS67212119 | 9 | 139895465 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.073E-6 | 0 | 8595 | gtex_brain_ba24 |
| RS12339673 | 9 | 139895482 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 8.075e-7 | 0 | 8612 | gtex_brain_ba24 |
| RS7854838 | 9 | 139895514 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.327E-7 | 0 | 8644 | gtex_brain_ba24 |
| RS7388671 | 9 | 139895998 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.99e-8 | 0 | 9128 | gtex_brain_ba24 |
| RS7390154 | 9 | 139896164 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.331E-9 | 0 | 9294 | gtex_brain_ba24 |
| RS7388696 | 9 | 139896168 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.055e-9 | 0 | 9298 | gtex_brain_ba24 |
| RS199897466 | 9 | 139896671 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.36E-7 | 0 | 9801 | gtex_brain_ba24 |
| RS2049040 | 9 | 139897164 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.934e-8 | 0 | 10294 | gtex_brain_ba24 |
| RS199757700 | 9 | 139897983 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 9.755e-7 | 0 | 11113 | gtex_brain_ba24 |
| RS4355883 | 9 | 139899265 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.436E-7 | 0 | 12395 | gtex_brain_ba24 |
| RS56065027 | 9 | 139899296 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.101E-6 | 0 | 12426 | gtex_brain_ba24 |
| RS4576515 | 9 | 139899352 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.815E-7 | 0 | 12482 | gtex_brain_ba24 |
| RS59031144 | 9 | 139903352 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 6.745e-8 | 0 | 16482 | gtex_brain_ba24 |
| RS7048567 | 9 | 139904037 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 4.563e-8 | 0 | 17167 | gtex_brain_ba24 |
| RS7849705 | 9 | 139869608 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.508E-6 | 0 | -17262 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3814499 | 9 | 139869914 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.829E-6 | 0 | -16956 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3814500 | 9 | 139870090 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.14E-6 | 0 | -16780 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3814501 | 9 | 139870113 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.651E-6 | 0 | -16757 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2049043 | 9 | 139877129 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.829E-6 | 0 | -9741 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7029565 | 9 | 139878317 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.829E-6 | 0 | -8553 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4880082 | 9 | 139878828 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.829E-6 | 0 | -8042 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2049041 | 9 | 139879113 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.829E-6 | 0 | -7757 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10870154 | 9 | 139881127 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.289E-6 | 0 | -5743 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10870155 | 9 | 139882740 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.622E-6 | 0 | -4130 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4880182 | 9 | 139883413 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.542E-6 | 0 | -3457 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10781529 | 9 | 139883948 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.158E-6 | 0 | -2922 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7860430 | 9 | 139884447 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.049E-6 | 0 | -2423 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10870157 | 9 | 139885762 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 5.469E-7 | 0 | -1108 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10870158 | 9 | 139885820 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.825E-7 | 0 | -1050 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10781530 | 9 | 139885948 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.817E-7 | 0 | -922 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10870159 | 9 | 139887042 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.434e-7 | 0 | 172 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3829902 | 9 | 139892629 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.517E-6 | 0 | 5759 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7470867 | 9 | 139893123 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.452E-7 | 0 | 6253 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72763205 | 9 | 139893881 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.517E-6 | 0 | 7011 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6560653 | 9 | 139894003 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 5.578E-7 | 0 | 7133 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7032381 | 9 | 139894331 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.728E-6 | 0 | 7461 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7022347 | 9 | 139894332 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 4.284e-7 | 0 | 7462 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12340777 | 9 | 139895429 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.86E-7 | 0 | 8559 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11999781 | 9 | 139895468 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.642E-6 | 0 | 8598 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12339673 | 9 | 139895482 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.514E-6 | 0 | 8612 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7854838 | 9 | 139895514 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.639E-7 | 0 | 8644 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7388671 | 9 | 139895998 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 5.788e-7 | 0 | 9128 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7388696 | 9 | 139896168 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.029E-6 | 0 | 9298 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS199897466 | 9 | 139896671 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 4.494E-7 | 0 | 9801 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2049040 | 9 | 139897164 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 5.617E-7 | 0 | 10294 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62585806 | 9 | 139897384 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.521E-6 | 0 | 10514 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12236330 | 9 | 139897927 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.265E-7 | 0 | 11057 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11145969 | 9 | 139897931 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.369E-8 | 0 | 11061 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4355883 | 9 | 139899265 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.073E-7 | 0 | 12395 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56065027 | 9 | 139899296 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 5.813E-7 | 0 | 12426 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4576515 | 9 | 139899352 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 3.682E-7 | 0 | 12482 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10114463 | 9 | 139899588 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.524E-6 | 0 | 12718 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS41306732 | 9 | 139902166 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.151E-6 | 0 | 15296 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS59031144 | 9 | 139903352 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.64E-7 | 0 | 16482 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7048567 | 9 | 139904037 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 1.009E-7 | 0 | 17167 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2271862 | 9 | 139906359 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 9.496E-7 | 0 | 19489 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2271863 | 9 | 139906513 | C9orf142 | ENSG00000148362.6 | 2.26E-6 | 0 | 19643 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Changolkar H2AFY目标DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |