基因页:grk4
概括?
基因 | 2868 |
象征 | grk4 |
同义词 | gprk2l | gprk4 | grk4a | it11 |
描述 | G蛋白偶联受体激酶4 |
参考 | MIM:137026|HGNC:HGNC:4543|ENSEMBL:ENSG00000125388|HPRD:00656|Vega:Otthumg00000159914 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P16.3 |
Pascal P值 | 0.058 |
Sherlock P值 | 0.157 |
胎儿β | 0.557 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07945480 | 4 | 2964972 | grk4 | -0.035 | 0.29 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GRK4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PNMA1 | 0.91 | 0.92 |
SLBP | 0.91 | 0.91 |
OGFOD1 | 0.90 | 0.89 |
C6orf168 | 0.89 | 0.90 |
CCDC109A | 0.89 | 0.93 |
KIFAP3 | 0.89 | 0.91 |
ppp3cc | 0.89 | 0.90 |
aasdhppt | 0.89 | 0.91 |
exoc1 | 0.89 | 0.89 |
ywhaz | 0.89 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.83 | -0.85 |
AF347015.31 | -0.81 | -0.83 |
AF347015.8 | -0.81 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.81 | -0.82 |
mt-cyb | -0.80 | -0.83 |
AF347015.27 | -0.80 | -0.83 |
AF347015.2 | -0.78 | -0.83 |
AF347015.15 | -0.77 | -0.82 |
AF347015.21 | -0.77 | -0.82 |
FXYD1 | -0.77 | -0.81 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta AGPCR途径 | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲基化调节的米西亚利亚 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈肺癌的生存 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |