基因页：GPT
概括？
| 基因 | 2875 |
| 象征 | GPT |
| 同义词 | aat1 | alt1 | gpt1 |
| 描述 | 谷氨酸 - 丙酮酸转氨酸酶（丙氨酸氨基转移酶） |
| 参考 | MIM：138200|HGNC：HGNC：4552|ENSEMBL：ENSG00000167701|HPRD：00689|Vega：Otthumg00000165176 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q24.3 |
| Pascal P值 | 0.135 |
| 胎儿β | -1.228 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG17869161 | 8 | 145729373 | GPT | 1.662E-4 | -0.337 | 0.033 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PRDM2 | 0.85 | 0.88 |
| Rapgef2 | 0.85 | 0.89 |
| SBNO1 | 0.84 | 0.87 |
| Tex2 | 0.84 | 0.87 |
| prkce | 0.83 | 0.87 |
| SDAD1 | 0.83 | 0.87 |
| ADRBK2 | 0.83 | 0.88 |
| CAMK1D | 0.83 | 0.85 |
| UBP1 | 0.82 | 0.85 |
| gria2 | 0.82 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Rhoc | -0.63 | -0.69 |
| AF347015.21 | -0.62 | -0.65 |
| 增强 | -0.61 | -0.71 |
| S100A16 | -0.61 | -0.65 |
| higd1b | -0.61 | -0.64 |
| AF347015.31 | -0.60 | -0.63 |
| Rab34 | -0.60 | -0.65 |
| MT-CO2 | -0.60 | -0.62 |
| C1orf54 | -0.60 | -0.71 |
| PLA2G5 | -0.60 | -0.65 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004021 | 丙氨酸转氨酶活性 | 经验 | 谷氨酸（GO期限：6） | 9119391 |
| 去：0004021 | 丙氨酸转氨酶活性 | nas | 谷氨酸（GO期限：6） | 1931970 |
| GO：0016847 | 1-氨基丙烷-1-羧酸盐合酶活性 | IEA | - | |
| 去：0030170 | 吡啶还毒素结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006094 | 糖异生 | nas | - | |
| 去：0009058 | 生物合成过程 | IEA | - | |
| 去：0006807 | 氮化代谢过程 | nas | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 9119391 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | nas | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg丙氨酸天冬氨酸和谷氨酸代谢 | 32 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta SARS途径 | 10 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome氨基酸合成和互转换跨跨 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 苏肝 | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlingemann皮肤致癌TPA DN | 29 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama FGF2目标 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 穆萨糖异生 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |