Summary
基因ID 2876
象征 GPX1
同义词 GPXD | GSHPX1
描述 谷胱甘肽过氧化物酶1
参考 MIM:138320|HGNC:HGNC:4553|ENSEMBL:ENSG00000233276|HPRD:11749|Vega:Otthumg00000156837
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.3
Pascal P值 0.023
胎儿β -0.34
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
梭子基底神经节

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS201181809 3 48932474 GPX1 ENSG00000233276.2 9.43071E-6 0.03 463559 gtex_brain_ba24
RS7619073 3 49125652 GPX1 ENSG00000233276.2 3.97685E-6 0.03 270381 gtex_brain_ba24
RS9883813 3 49370544 GPX1 ENSG00000233276.2 5.41001E-6 0.02 25489 gtex_brain_putamen_basal
RS9854297 3 49417896 GPX1 ENSG00000233276.2 1.00928E-5 0.02 -21863 gtex_brain_putamen_basal
RS73073004 3 49490020 GPX1 ENSG00000233276.2 1.32611E-5 0.02 -93987 gtex_brain_putamen_basal
RS4855853 3 49579331 GPX1 ENSG00000233276.2 1.16399E-5 0.02 -183298 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SNX10 0.91 0.91
OLFM3 0.90 0.85
Rab6b 0.89 0.88
MOAP1 0.88 0.90
MAPK9 0.86 0.92
REEP5 0.86 0.87
ATP1B1 0.86 0.92
WBSCR17 0.85 0.88
ZMAT4 0.85 0.82
TPD52 0.85 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NME4 -0.48 -0.60
sigirr -0.47 -0.56
RPL28 -0.43 -0.51
EMX2 -0.43 -0.57
Bcl7c -0.43 -0.52
RAB13 -0.42 -0.53
RPL23A -0.42 -0.45
SH2D2A -0.42 -0.44
GRTP1 -0.41 -0.43
EFEMP2 -0.41 -0.39

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0004602 谷胱甘肽过氧化物酶活性 EXP 8428933
GO:0004602 谷胱甘肽过氧化物酶活性 IEA -
去:0008430 硒结合 IEA -
去:0008539 蛋白酶体抑制剂活性 艾达 12751788
GO:0017124 SH3域结合 IPI 12893824
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
GO:0043295 谷胱甘肽结合 我知道了 12829378
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001836 从线粒体释放细胞色素C 小鬼 12221075
去:0008631 induction of apoptosis by oxidative stress IEA -
去:0009650 紫外线保护 小鬼 17097614
去:0010269 对硒离子的反应 小鬼 12810669
去:0006749 glutathione metabolic process 艾达 12829378
去:0006979 对氧化应激的反应 IEA -
去:0006916 抗凋亡 小鬼 12221075
GO:0033599 调节乳腺上皮细胞增殖 小鬼 16945136
GO:0042744 过氧化氢分解代谢过程 IEA -
去:0040029 调节基因表达,表观遗传学 艾达 16132718
GO:0043154 胱天蛋白酶活性的负调节 小鬼 12221075
GO:0055114 还原氧化 IEA -
GO:0060047 心脏收缩 小鬼 14573732
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 EXP 8428933
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005739 线粒体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg谷胱甘肽代谢 50 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg蛛网膜酸代谢 58 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS 53 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Huntingtons病 185 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA免费PATHWAY 10 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID P53下游途径 137 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
核苷酸的反应组代谢 72 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组嘌呤分解代谢 10 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组嘌呤代谢 33 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过CD40 DN HOLLMANN细胞凋亡 267 178 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础DN 455 304 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌 358 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GROSS ELK3靶向 27 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOUSTIS ROS 36 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gnatenko血小板签名 48 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ferrando Lyl1邻居 15 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
整合素信号传导 59 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
takao对UVB辐射的响应 86 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张增殖与静止 51 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHU CMV 24 HR DN 91 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee衰老的新皮层 89 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhu CMV全部DN 128 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha Ros 7 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan V1后期分化基因上升 32 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jison Sickle细胞疾病 181 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤MS DN 46 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Huang Gata2靶向 149 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway