基因页:GPX1
Summary?
基因ID | 2876 |
象征 | GPX1 |
同义词 | GPXD | GSHPX1 |
描述 | 谷胱甘肽过氧化物酶1 |
参考 | MIM:138320|HGNC:HGNC:4553|ENSEMBL:ENSG00000233276|HPRD:11749|Vega:Otthumg00000156837 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.3 |
Pascal P值 | 0.023 |
胎儿β | -0.34 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 梭子基底神经节 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS201181809 | 3 | 48932474 | GPX1 | ENSG00000233276.2 | 9.43071E-6 | 0.03 | 463559 | gtex_brain_ba24 |
RS7619073 | 3 | 49125652 | GPX1 | ENSG00000233276.2 | 3.97685E-6 | 0.03 | 270381 | gtex_brain_ba24 |
RS9883813 | 3 | 49370544 | GPX1 | ENSG00000233276.2 | 5.41001E-6 | 0.02 | 25489 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9854297 | 3 | 49417896 | GPX1 | ENSG00000233276.2 | 1.00928E-5 | 0.02 | -21863 | gtex_brain_putamen_basal |
RS73073004 | 3 | 49490020 | GPX1 | ENSG00000233276.2 | 1.32611E-5 | 0.02 | -93987 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4855853 | 3 | 49579331 | GPX1 | ENSG00000233276.2 | 1.16399E-5 | 0.02 | -183298 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GPX1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SNX10 | 0.91 | 0.91 |
OLFM3 | 0.90 | 0.85 |
Rab6b | 0.89 | 0.88 |
MOAP1 | 0.88 | 0.90 |
MAPK9 | 0.86 | 0.92 |
REEP5 | 0.86 | 0.87 |
ATP1B1 | 0.86 | 0.92 |
WBSCR17 | 0.85 | 0.88 |
ZMAT4 | 0.85 | 0.82 |
TPD52 | 0.85 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NME4 | -0.48 | -0.60 |
sigirr | -0.47 | -0.56 |
RPL28 | -0.43 | -0.51 |
EMX2 | -0.43 | -0.57 |
Bcl7c | -0.43 | -0.52 |
RAB13 | -0.42 | -0.53 |
RPL23A | -0.42 | -0.45 |
SH2D2A | -0.42 | -0.44 |
GRTP1 | -0.41 | -0.43 |
EFEMP2 | -0.41 | -0.39 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0004602 | 谷胱甘肽过氧化物酶活性 | EXP | 8428933 | |
GO:0004602 | 谷胱甘肽过氧化物酶活性 | IEA | - | |
去:0008430 | 硒结合 | IEA | - | |
去:0008539 | 蛋白酶体抑制剂活性 | 艾达 | 12751788 | |
GO:0017124 | SH3域结合 | IPI | 12893824 | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
GO:0043295 | 谷胱甘肽结合 | 我知道了 | 12829378 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001836 | 从线粒体释放细胞色素C | 小鬼 | 12221075 | |
去:0008631 | induction of apoptosis by oxidative stress | IEA | - | |
去:0009650 | 紫外线保护 | 小鬼 | 17097614 | |
去:0010269 | 对硒离子的反应 | 小鬼 | 12810669 | |
去:0006749 | glutathione metabolic process | 艾达 | 12829378 | |
去:0006979 | 对氧化应激的反应 | IEA | - | |
去:0006916 | 抗凋亡 | 小鬼 | 12221075 | |
GO:0033599 | 调节乳腺上皮细胞增殖 | 小鬼 | 16945136 | |
GO:0042744 | 过氧化氢分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0040029 | 调节基因表达,表观遗传学 | 艾达 | 16132718 | |
GO:0043154 | 胱天蛋白酶活性的负调节 | 小鬼 | 12221075 | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
GO:0060047 | 心脏收缩 | 小鬼 | 14573732 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | EXP | 8428933 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - |