基因页:GRB7
Summary?
基因ID | 2886 |
Symbol | GRB7 |
同义词 | - |
描述 | 生长因子受体结合蛋白7 |
参考 | MIM:601522|HGNC:HGNC:4567|ENSEMBL:ENSG00000141738|HPRD:03311|Vega:Otthumg00000133253 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 0.016 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0126 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GRB7_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KCNB1 | 0.96 | 0.80 |
Trhde | 0.96 | 0.89 |
DLGAP2 | 0.94 | 0.76 |
TMEM132D | 0.94 | 0.83 |
KCNMA1 | 0.92 | 0.84 |
SCN8A | 0.92 | 0.71 |
ATP2B2 | 0.92 | 0.74 |
Egr3 | 0.91 | 0.86 |
creg2 | 0.91 | 0.86 |
diras2 | 0.91 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.48 | -0.71 |
FADS2 | -0.45 | -0.47 |
RPL23A | -0.44 | -0.65 |
C9orf46 | -0.43 | -0.59 |
traf4 | -0.43 | -0.61 |
SEMA4B | -0.43 | -0.44 |
AC006276.2 | -0.42 | -0.50 |
RPLP1 | -0.42 | -0.62 |
GTF3C6 | -0.42 | -0.54 |
AC135586.1 | -0.41 | -0.54 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005070 | SH3/SH2适配器活动 | 塔斯 | 9710451 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15806159 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007173 | epidermal growth factor receptor signaling pathway | 塔斯 | 9710451 | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
平静1 | Calml2 |CAMI |DD132 |PHKD | 钙调蛋白1(磷酸化酶激酶,三角洲) | GRB7与CAM相互作用。这种相互作用是根据大鼠和未指定物种的人类Grb7和CAM之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15806159 |
egfr | ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | - | HPRD | 9710451 |
ERBB2 | CD340 |her-2 |her-2/neu |her2 |neu |ngl |TKR1 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2,神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 9079677 |
ERBB3 | ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒癌基因同源物3(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 9516479 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD | 10377264 |
insr | CD220 |HHF5 | 胰岛素受体 | - | HPRD,Biogrid | 10803466 |
成套工具 | c-kit |CD117 |PBT |scfr | v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog | - | HPRD,Biogrid | 10377264 |
ly6g6f | C6orf21 |g6f |ly6g6d |NG32 | 淋巴细胞抗原6复合物,基因座G6F | - | HPRD,Biogrid | 12852788 |
PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | - | HPRD,Biogrid | 10446223 |
ret | CDHF12 |HSCR1 |men2a |men2b |mtc1 |PTC |ret-ele1 |RET51 | ret原癌基因 | - | HPRD,Biogrid | 8631863 |
RND1 | arhs |FLJ42294 |Rho6 |罗斯 | Rho家族GTPase 1 | - | HPRD,Biogrid | 10664463 |
SFN | 是的 | Stratifin | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15778465 |
TEK | CD202B | TIE-2 | TIE2 | VMCM | VMCM1 | TEK酪氨酸激酶,内皮 | - | HPRD | 10521483 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-193 | 332 | 338 | M8 | HSA-MIR-193A | AACUGGCCUACAAAGUCCCAG |
HSA-MIR-193B | aacuggcccucaaagucccgcuuu |