Summary
基因ID 2886
Symbol GRB7
同义词 -
描述 生长因子受体结合蛋白7
参考 MIM:601522|HGNC:HGNC:4567|ENSEMBL:ENSG00000141738|HPRD:03311|Vega:Otthumg00000133253
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 0.016

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0126

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KCNB1 0.96 0.80
Trhde 0.96 0.89
DLGAP2 0.94 0.76
TMEM132D 0.94 0.83
KCNMA1 0.92 0.84
SCN8A 0.92 0.71
ATP2B2 0.92 0.74
Egr3 0.91 0.86
creg2 0.91 0.86
diras2 0.91 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.48 -0.71
FADS2 -0.45 -0.47
RPL23A -0.44 -0.65
C9orf46 -0.43 -0.59
traf4 -0.43 -0.61
SEMA4B -0.43 -0.44
AC006276.2 -0.42 -0.50
RPLP1 -0.42 -0.62
GTF3C6 -0.42 -0.54
AC135586.1 -0.41 -0.54

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005070 SH3/SH2适配器活动 塔斯 9710451
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15806159
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007173 epidermal growth factor receptor signaling pathway 塔斯 9710451
去:0007165 信号转导 IEA -

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
平静1 Calml2 |CAMI |DD132 |PHKD 钙调蛋白1(磷酸化酶激酶,三角洲) GRB7与CAM相互作用。这种相互作用是根据大鼠和未指定物种的人类Grb7和CAM之间的相互作用进行建模的。 绑定 15806159
egfr ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) - HPRD 9710451
ERBB2 CD340 |her-2 |her-2/neu |her2 |neu |ngl |TKR1 V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2,神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物(Avian) - HPRD,Biogrid 9079677
ERBB3 ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 V-ERB-B2红细胞白血病病毒癌基因同源物3(Avian) - HPRD,Biogrid 9516479
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD 10377264
insr CD220 |HHF5 胰岛素受体 - HPRD,Biogrid 10803466
成套工具 c-kit |CD117 |PBT |scfr v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog - HPRD,Biogrid 10377264
ly6g6f C6orf21 |g6f |ly6g6d |NG32 淋巴细胞抗原6复合物,基因座G6F - HPRD,Biogrid 12852788
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 - HPRD,Biogrid 10446223
ret CDHF12 |HSCR1 |men2a |men2b |mtc1 |PTC |ret-ele1 |RET51 ret原癌基因 - HPRD,Biogrid 8631863
RND1 arhs |FLJ42294 |Rho6 |罗斯 Rho家族GTPase 1 - HPRD,Biogrid 10664463
SFN 是的 Stratifin 亲和力捕获ms Biogrid 15778465
TEK CD202B | TIE-2 | TIE2 | VMCM | VMCM1 TEK酪氨酸激酶,内皮 - HPRD 10521483


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
ST整合素信号通路 82 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID EPHB FWD途径 40 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID RET路径 39 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID血管生成素受体途径 50 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID FAK PATHWAY 59 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCF套件的Reactome信号传导 78 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SIGNALING BY ERBB2 101 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Tie2信号传导 17 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PDGF的Reactome信号传导 122 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome下游信号转导 95 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组止血 466 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质 450 256 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向DN 384 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Baris甲状腺癌DN 59 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌簇8 7 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SIMBULAN UV RESPONSE NORMAL DN 33 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bertucci侵入性癌导管与小叶 25 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jechlinger上皮到间充质转变DN 66 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HALMOS CEBPA目标DN 46 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAVIN FOXP3 TARGETS CLUSTER P3 160 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌 871 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mueller Plurinet 299 189 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOFFMANN PRE BI TO LARGE PRE BII LYMPHOCYTE DN 75 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹上皮类间皮瘤 17 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸的反应 857 456 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR DN 91 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN 505 328 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delpuech FOXO3靶向 68 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞DN 428 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang EGF间隔DN 214 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-193 332 338 M8 HSA-MIR-193A AACUGGCCUACAAAGUCCCAG
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu