基因页：gria1
概括？
| 基因 | 2890 |
| 象征 | gria1 |
| 同义词 | gluh1 | glur1 | glura | glua1 | hbgr1 |
| 描述 | 谷氨酸离子受体AMPA型亚基1 |
| 参考 | MIM：138248|HGNC：HGNC：4571|Ensembl：ENSG00000155511|HPRD：00695|Vega：Otthumg00000130148 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q31.1 |
| Pascal P值 | 0.197 |
| 胎儿β | -0.218 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 配体门控离子信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 G2CDB.Humanarc g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00459 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：5 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.4005 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4958734 | CHR5 | 153789504 | gria1 | 2890 | 0.1 | 顺式 | ||
| RS6712415 | CHR2 | 133868796 | gria1 | 2890 | 0.05 | 反式 | ||
| RS10184338 | CHR2 | 133868936 | gria1 | 2890 | 0.07 | 反式 | ||
| RS10172235 | CHR2 | 133869155 | gria1 | 2890 | 0.17 | 反式 | ||
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | gria1 | 2890 | 8.566e-5 | 反式 | ||
| RS3988303 | CHR8 | 19776538 | gria1 | 2890 | 0.15 | 反式 | ||
| RS11793484 | Chr9 | 317239 | gria1 | 2890 | 0.03 | 反式 | ||
| RS10970457 | Chr9 | 326183 | gria1 | 2890 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 门 | 0.90 | 0.87 |
| C3orf39 | 0.89 | 0.88 |
| scyl1 | 0.89 | 0.87 |
| FAM127A | 0.88 | 0.86 |
| ATP6AP1 | 0.88 | 0.87 |
| RNF123 | 0.87 | 0.83 |
| ACP2 | 0.86 | 0.85 |
| SLC45A1 | 0.86 | 0.87 |
| CDIPT | 0.86 | 0.86 |
| C17orf28 | 0.85 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.58 | -0.44 |
| AF347015.18 | -0.56 | -0.48 |
| NSBP1 | -0.56 | -0.55 |
| AL139819.3 | -0.53 | -0.51 |
| MT-ATP8 | -0.52 | -0.42 |
| AF347015.8 | -0.52 | -0.39 |
| GNG11 | -0.52 | -0.45 |
| MT-CO2 | -0.50 | -0.37 |
| 鼻孔 | -0.50 | -0.39 |
| AF347015.31 | -0.50 | -0.37 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005234 | 细胞外谷氨酸门控离子通道活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：11） | - |
| GO：0015277 | 海藻酸盐选择性谷氨酸受体活性 | 塔斯 | 谷氨酸（GO期限：8） | 1311100 |
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 1311100 |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 1311100 | |
| 去：0007616 | 长期记忆 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| GO：0031623 | 受体内在化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0014069 | 突触后密度 | IEA | 突触（GO期限：10） | - |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 塔斯 | 1311100 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| cacng2 | MGC138502 |MGC138504 | 钙通道，电压依赖性，伽马亚基2 | - | HPRD，Biogrid | 11140673 |
| canx | CNX |FLJ26570 |IP90 |P90 | 钙粘蛋白 | - | HPRD | 10461883 |
| DLG1 | DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG | 圆盘，大型同源物1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9677374|11567040 |
| EPB41L1 | 4.1n |DKFZP686H17242 |KIAA0338 |MGC11072 | 红细胞膜蛋白条带4.1样带1 | - | HPRD，Biogrid | 11050113 |
| EPB41L2 | 4.1-g |DKFZP781D1972 |DKFZP781H1755 | 红细胞膜蛋白条带4.1样2 | - | HPRD，Biogrid | 11050113 |
| gria2 | glur2 |Glurb |glur-k2 |HBGR2 | 谷氨酸受体，离子型，AMPA 2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10358037 |
| gria4 | glur4 |glur4c |glurd | 谷氨酸受体，离子营养，AMPA 4 | - | HPRD，Biogrid | 9466455 |
| 网格2 | MGC117022 |MGC117023 |MGC117024 | 谷氨酸受体，离子型，三角洲2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12573530 |
| 网格2 | MGC117022 |MGC117023 |MGC117024 | 谷氨酸受体，离子型，三角洲2 | Glur1与Glur-Delta-2相互作用 | 绑定 | 12573530 |
| Grik2 | EAA4 |Glr6 |Gluk6 |glur6 |MGC74427 |MRT6 | 谷氨酸受体，离子型，海藻酸盐2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 8288598 |
| Grik2 | EAA4 |Glr6 |Gluk6 |glur6 |MGC74427 |MRT6 | 谷氨酸受体，离子型，海藻酸盐2 | - | HPRD | 10358037 |
| grip1 | 紧握 | 谷氨酸受体相互作用蛋白1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11891216 |
| Homer1 | 荷马|homer1a |homer1b |homer1c |SYN47 |VES-1 | 荷马同源物1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9069287|9808458 |11418862 |
| HSPA5 | bip |FLJ26106 |GRP78 |mif2 | 热休克70KDA蛋白5（葡萄糖调节蛋白，78KDA） | - | HPRD | 10461883 |
| Pick1 | MGC15204 |选择|prkcabp | 蛋白质与prkca 1相互作用 | - | HPRD，Biogrid | 11891216 |
| SDCBP | MDA-9 |ST1 |SYCL |Tacip18 | 联合结合蛋白（同步） | - | HPRD，Biogrid | 11891216 |
| tanc1 | KIAA1728 |ROLSB |田 | 四肽重复，arnkyrin重复和包含1 | - | HPRD | 15673434 |
| TRPC1 | HTRP-1 |MGC133334 |MGC133335 |TRP1 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员1 | - | HPRD | 14614461 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg长期增强 | 70 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS | 53 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID EPHB FWD途径 | 40 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AMPA受体的Reactome贩运 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 含有AMPA受体的GLUR2的Reactome贩运 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NMDA受体在谷氨酸结合和突触后事件上的反应组激活 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NMDA受体谷氨酸结合和激活的反应组释放 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莫迪海马后产后 | 63 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江是衰老下丘脑DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染8小时 | 105 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时 | 61 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |