基因页面:GRID2
总结吗?
| GeneID | 2895年 |
| 象征 | GRID2 |
| 同义词 | GluD2 | SCAR18 |
| 描述 | 谷氨酸受体ionotropicδ亚基类型2 |
| 参考 | MIM: 602368|HGNC: HGNC: 4576|运用:ENSG00000152208|HPRD: 06781|织女:OTTHUMG00000130975 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 4的时候 |
| 帕斯卡假定值 | 0.01 |
| 这样假定值 | 0.017 |
| 胎儿β | -0.289 |
| eGene | 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.638 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:7 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GRID2 | chr4 | 94411901 | C | G | NM_001510 | p.657T >年代 | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7370564 | 0 | GRID2 | 2895年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC7A6 | 0.88 | 0.85 |
| NOL6 | 0.86 | 0.88 |
| MFHAS1 | 0.86 | 0.83 |
| SSBP3 | 0.85 | 0.90 |
| SEZ6 | 0.84 | 0.81 |
| CTNND2 | 0.84 | 0.81 |
| RP1-21O18.1 | 0.84 | 0.79 |
| LZTS1 | 0.83 | 0.79 |
| PTPRS | 0.83 | 0.84 |
| ZNF142 | 0.83 | 0.84 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SERPINB6 | -0.65 | -0.71 |
| AF347015.31 | -0.61 | -0.74 |
| AL139819.3 | -0.61 | -0.74 |
| AF347015.27 | -0.61 | -0.76 |
| MT-CO2 | -0.60 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.60 | -0.73 |
| BDH2 | -0.60 | -0.70 |
| AF347015.8 | -0.59 | -0.75 |
| MT-CYB | -0.59 | -0.73 |
| S100A16 | -0.58 | -0.71 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004970 | ionotropic谷氨酸受体的活动 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0005234 | extracellular-glutamate-gated离子通道的活动 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:11) | - - - - - - |
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005216 | 离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0060079 | 兴奋性突触后膜电位的监管 | 国际能源机构 | 神经元,Synap(词级:10) | - - - - - - |
| 去:0007215 | 谷氨酸信号通路 | 助教 | 谷氨酸(术语层面:7) | 9465309 |
| 去:0035249 | 突触传递,glutamatergic | 国际能源机构 | Synap,神经元,谷氨酸神经递质(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0060134 | 前脉冲抑制 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0019717 | 突触体 | 国际能源机构 | Synap,大脑(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0045211 | 突触后膜 | 国际能源机构 | Synap,神经递质(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 9465309 | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG长期萧条 | 70年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究人类MITODB 6 2002 | 429年 | 260年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN | 50 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤颈板 | 177年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |