概括
基因 28991
象征 commd5
同义词 HCARG | HT002
描述 包含5的通信域
参考 MIM:608216|HGNC:HGNC:17902|ENSEMBL:ENSG00000170619|HPRD:16301|Vega:Otthumg00000165251
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24.3
Pascal P值 0.041
Sherlock P值 0.413
胎儿β -0.699
DMG 2(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10719100 8 146078187 commd5 2.3e-5 -0.25 0.017 DMG:Wockner_2014
CG24648864 8 146078283 commd5 3.72E-10 -0.019 7.47E-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 commd5 28991 4.229E-9 反式
RS7584986 CHR2 184111432 commd5 28991 0 反式
RS6797307 CHR3 8601563 commd5 28991 0.12 反式
RS17762315 CHR5 76807576 commd5 28991 0.01 反式
RS7787830 CHR7 98797019 commd5 28991 0.03 反式
RS11139334 Chr9 84209393 commd5 28991 0.06 反式
RS16955618 CHR15 29937543 commd5 28991 5.513E-13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因