基因页面:GRIK5

总结吗?
GeneID 2901年
象征 GRIK5
同义词 EAA2 | GRIK2 | GluK5 | KA2
描述 谷氨酸受体ionotropic kainate类型单元5
参考 MIM: 600283|HGNC: HGNC: 4583|运用:ENSG00000105737|HPRD: 02614|织女:OTTHUMG00000044573
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 q13.2
帕斯卡假定值 0.14
夏洛克假定值 0.381
胎儿β -0.572
DMG 1(#研究)
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标
潜在的突触基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:9
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0192

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg08955995 19 42503412 GRIK5 5.273的军医 0.418 0.048 DMG: Wockner_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf201 0.80 0.83
GRIA4 0.80 0.81
STYK1 0.78 0.83
LIG4 0.77 0.79
GPR61 0.76 0.84
WBSCR17 0.76 0.78
NALCN 0.76 0.84
KCNC4 0.75 0.80
CYB561 0.75 0.78
PDGFB 0.75 0.74
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SIGIRR -0.37 -0.45
RPL18 -0.36 -0.46
RPS16P1 -0.36 -0.50
RPL24 -0.36 -0.41
CSRP2 -0.36 -0.39
RPL38 -0.35 -0.50
UXT -0.35 -0.38
RPL28 -0.35 -0.47
RPL35 -0.35 -0.44
RPL31 -0.35 -0.40

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005234 extracellular-glutamate-gated离子通道的活动 国际能源机构 谷氨酸(术语层面:11) - - - - - -
去:0015277 kainate选择性谷氨酸受体的活动 艾达 谷氨酸(术语层面:8) 1321949
去:0004872 受体的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005216 离子通道的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0060079 兴奋性突触后膜电位的监管 国际能源机构 神经元,Synap(词级:10) - - - - - -
去:0031630 调节突触囊泡融合到突触前膜 国际能源机构 Synap,神经递质(术语层面:11) - - - - - -
去:0007268 突触传递 NAS Synap神经元,神经递质(术语层面:6) - - - - - -
去:0035249 突触传递,glutamatergic 国际能源机构 Synap,神经元,谷氨酸神经递质(术语层面:8) - - - - - -
去:0006811 离子传输 国际能源机构 - - - - - -
去:0042391 膜电位的监管 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0042734 突触前膜 国际能源机构 神经元轴突,Synap(术语层面:5) - - - - - -
去:0032983 kainate选择性谷氨酸受体复杂 国际能源机构 谷氨酸(词级:10) - - - - - -
去:0045211 突触后膜 国际能源机构 Synap,神经递质(术语层面:5) - - - - - -
去:0045202 突触 国际能源机构 Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) - - - - - -
去:0005624 膜分数 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 NAS - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0030054 细胞结 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 272年 195年 所有SZGR 2.0基因通路
在化学突触REACTOME传输 186年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME神经系统 279年 221年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME神经递质受体结合和下游传播的突触后细胞 137年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
KAINATE REACTOME激活谷氨酸受体在绑定 31日 23 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME IONOTROPIC KAINATE受体的活性 11 11 所有SZGR 2.0基因通路
加白血病干细胞 133年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯瓦尔德在胶原凝胶DN造血干细胞 275年 168年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML复发预后 35 24 所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 882年 572年 所有SZGR 2.0基因通路
郭十六进制的目标了 81年 54 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML生存 129年 87年 所有SZGR 2.0基因通路
开罗肝脏DN发展 222年 141年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP 718年 401年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP 445年 257年 所有SZGR 2.0基因通路
经典VERHAAK胶质母细胞瘤 162年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
德拉克洛瓦RARG绑定MEF 367年 231年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 375 535年 541年 1 hsa - mir - 375 UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA
mir - 376 449年 455年 m8 hsa - mir - 376 a AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU
hsa - mir - 376 b AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU