基因页：Grin2d
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| 基因ID | 2906 |
| Symbol | Grin2d |
| 同义词 | EB11|GluN2D|NMDAR2D|NR2D |
| 描述 | 谷氨酸离子受体NMDA型亚基2D |
| 参考 | MIM：602717|HGNC：HGNC：4588|ENSEMBL：ENSG00000105464|HPRD：04095|Vega：Otthumg00000183304 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.33 |
| Pascal P值 | 0.35 |
| 胎儿β | -0.967 |
| 支持 | 配体门控离子信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet 潜在的突触基因 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008), association studies | 1 | 链接到Szgene |
| Literature | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 4 | |
| 网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献：0.092 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HSP90B1 | 0.87 | 0.85 |
| TM9SF2 | 0.86 | 0.84 |
| COPB2 | 0.86 | 0.83 |
| SRP54 | 0.86 | 0.86 |
| Rab5a | 0.86 | 0.83 |
| ATP2C1 | 0.85 | 0.84 |
| canx | 0.85 | 0.83 |
| NIPA2 | 0.85 | 0.79 |
| 卡尔 | 0.84 | 0.79 |
| PSMD1 | 0.83 | 0.83 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.69 | -0.59 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.66 |
| FXYD1 | -0.67 | -0.62 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.64 |
| AF347015.31 | -0.66 | -0.64 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.63 |
| AF347015.2 | -0.64 | -0.65 |
| higd1b | -0.64 | -0.60 |
| ifi27 | -0.63 | -0.60 |
| mt-cyb | -0.62 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0004972 | N-甲基-D-天冬氨酸选择性谷氨酸受体活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：8） | - |
| 去：0005234 | 细胞外谷氨酸门控离子通道活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：11） | - |
| 去：0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
| GO:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005509 | calcium ion binding | IEA | - | |
| 去：0005216 | ion channel activity | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001964 | 惊吓反应 | IEA | - | |
| 去：0007165 | signal transduction | nas | 9480759 | |
| 去：0008344 | 成人运动行为 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 去：0051930 | regulation of sensory perception of pain | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019717 | 突触体 | IEA | Synap, Brain (GO term level: 7) | - |
| GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | synapse | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | cell junction | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABL1 | ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL | C-ABL癌基因1，受体酪氨酸激酶 | - | HPRD | 10777567 |
| DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘，大型同源物4（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 7569905 |
| DLGAP4 | DAP4 |KIAA0964 |MGC131862 |RP5-977B1.6 |SAPAP4 | 圆盘，大（果蝇）同源物相关蛋白4 | - | HPRD | 10862698 |
| DNM1 | DNM | Dynamin 1 | - | HPRD | 10862698 |
| DUSP4 | HVH2 |MKP-2 |mkp2 |典型 | 双重特异性磷酸酶4 | - | HPRD | 10862698 |
| grin1 | NMDA1 |NMDAR1 |NR1 | 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸1 | - | HPRD | 12191494 |
| IL16 | FLJ16806 |FLJ42735 |FLJ44234 |HST19289 |IL-16 |LCF |Pril-16 | 白介素16（淋巴细胞趋化因子） | - | HPRD，Biogrid | 10479680 |
| inadl | cipp |FLJ26982 |类似|patj | 类似果蝇（果蝇） | - | HPRD | 9647694 |
| MAP2 | DKFZP686I2148 |map2a |MAP2B |MAP2C | 微管相关蛋白2 | - | HPRD | 10862698 |
| 纳米1 | NOS1 | 纳米同源物1（果蝇） | - | HPRD | 10862698 |
| PPP2R1A | MGC786 |Pr65a | 蛋白质磷酸酶2（以前为2A），调节亚基A，α同工型 | - | HPRD | 10862698 |
| syngap1 | DKFZP761G1421 |KIAA1938 |rasa1 |rasa5 |syngap | synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) | - | HPRD | 10862698 |
| TJP1 | DKFZP686M05161 |MGC133289 |zo-1 | tight junction protein 1 (zona occludens 1) | - | HPRD | 10862698 |