基因页面:MED4
总结吗?
| GeneID | 29079年 |
| 象征 | MED4 |
| 同义词 | ARC36 | DRIP36 | HSPC126 | TRAP36 | VDRIP |
| 描述 | 中介复杂单元4 |
| 参考 | MIM: 605718|HGNC: HGNC: 17903|运用:ENSG00000136146|HPRD: 16145|织女:OTTHUMG00000016891 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 13 q14.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.336 |
| 夏洛克假定值 | 0.971 |
| 胎儿β | 0.114 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 小脑半球 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg24429159 | 13 | 48669391 | MED4 | 5.21 e-9 | -0.011 | 2.92 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4941618 | chr13 | 48517288 | MED4 | 29079年 | 0 | 独联体 | ||
| rs7996581 | chr13 | 48636963 | MED4 | 29079年 | 6.294的军医 | 独联体 | ||
| rs7332363 | chr13 | 48666760 | MED4 | 29079年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs7332994 | chr13 | 48674134 | MED4 | 29079年 | 1.316的军医 | 独联体 | ||
| rs1410116 | chr13 | 48685915 | MED4 | 29079年 | 5.356的军医 | 独联体 | ||
| rs7326381 | chr13 | 48696213 | MED4 | 29079年 | 6.016的军医 | 独联体 | ||
| rs7317685 | chr13 | 48715752 | MED4 | 29079年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs4941618 | chr13 | 48517288 | MED4 | 29079年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs7996581 | chr13 | 48636963 | MED4 | 29079年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs7332994 | chr13 | 48674134 | MED4 | 29079年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs1410116 | chr13 | 48685915 | MED4 | 29079年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs7326381 | chr13 | 48696213 | MED4 | 29079年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体的活动 | 艾达 | 12218053 | |
| 去:0003712 | 代数余子式转录活动 | 艾达 | 12218053 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17438371 | |
| 去:0016455 | RNA聚合酶II转录中介活动 | 艾达 | 10882111 | |
| 去:0016563 | 转录激活活性 | 艾达 | 10198638 | |
| 去:0030374 | ligand-dependent核受体转录辅激活活动 | NAS | 10235266 | |
| 去:0042809 | 维生素D受体结合 | NAS | 10235266 | |
| 去:0046966 | 甲状腺激素受体结合 | 艾达 | 10198638 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 艾达 | 12218053 | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030521 | 雄激素受体信号通路 | 艾达 | 12218053 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000119 | 中介复杂 | 艾达 | 10882111 | |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 10235267 | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AP2M1 | AP50 | CLAPM1 | mu2 | adaptor-related蛋白复合物2μ1亚基 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| MCRS1 | ICP22BP | INO80Q | MCRS2 | MSP58 |只有 | microspherule蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| MED10 | 16种| MGC5309 | NUT2 | TRG20 | 中介复杂10亚基 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 14638676|15175163 |
| MED19 | DT2P1G7 | LCMR1 | 中介复杂单元19 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 14638676|15175163 |
| MED25 | ACID1 | ARC92 | DKFZp434K0512 | MGC70671 |只有| PTOV2 | TCBAP0758 | 中介复杂单元25 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 14638676 |
| MED26 | CRSP7 | CRSP70 | 中介复杂单元26 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 15175163 |
| MED28 | 1500003 d12rik | DKFZp434N185 | | EG1 magicin | 中介复杂28亚基 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 15175163 |
| MED29 | DKFZp434H247 | IXL | 中介复杂单元29 | - - - - - - | HPRD | 14576168 |
| MED29 | DKFZp434H247 | IXL | 中介复杂单元29 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 14638676|15175163 |
| MED30 | MGC9890 | THRAP6 | TRAP25 | 中介复杂单元30 | TRAP36与TRAP25交互。这种交互是仿照人类TRAP36和鼠标TRAP25证明之间的交互。 | 绑定 | 12584197 |
| MED30 | MGC9890 | THRAP6 | TRAP25 | 中介复杂单元30 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12584197 |
| MED9 | FLJ10193 | MED25 | MGC138234 | 中介复杂单元9 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 15175163 |
| MED9 | FLJ10193 | MED25 | MGC138234 | 中介复杂单元9 | - - - - - - | HPRD | 14638676 |
| TNFAIP8 | GG2-1 | mdc - 3.13 | SCC-S2 | SCCS2 | 肿瘤坏死因子,alpha-induced蛋白质8 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME发育生物学 | 396年 | 292年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PPARA激活基因表达 | 104年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME转录调控的白色脂肪细胞的分化 | 72年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘CMYB目标了 | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘VMYB目标了 | 127年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX5 DN | 8 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林黑色素瘤拷贝数DN | 41 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |