基因页面:NR3C1
总结吗?
| GeneID | 2908年 |
| 象征 | NR3C1 |
| 同义词 | GCCR | GCR | GCRST | GR | GRL |
| 描述 | 核受体亚科3 C组的成员1 |
| 参考 | MIM: 138040|HGNC: HGNC: 7978|运用:ENSG00000113580|HPRD: 00679|织女:OTTHUMG00000129677 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q31.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.068 |
| 胎儿β | -2.483 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00459 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01718 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.1127 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg18146873 | 5 | 142782827 | NR3C1 | 2.4 e-8 | -0.017 | 7.84 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2407038 | chr8 | 3588530 | NR3C1 | 2908年 | 0.18 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MYRIP | 0.77 | 0.77 |
| RAPGEFL1 | 0.73 | 0.76 |
| IQSEC2 | 0.73 | 0.74 |
| GARNL4 | 0.72 | 0.73 |
| LRRK1 | 0.72 | 0.71 |
| KIAA1045 | 0.72 | 0.74 |
| PITPNM3 | 0.72 | 0.74 |
| GDA | 0.71 | 0.75 |
| PITPNM2 | 0.71 | 0.73 |
| AJAP1 | 0.70 | 0.70 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BCL7C | -0.36 | -0.40 |
| UXT | -0.35 | -0.31 |
| SNRPG | -0.34 | -0.39 |
| RPL35 | -0.34 | -0.38 |
| RPS12 | -0.34 | -0.39 |
| C21orf57 | -0.34 | -0.36 |
| RPL27 | -0.34 | -0.32 |
| RPL24 | -0.34 | -0.31 |
| RPL37 | -0.33 | -0.41 |
| RPS27A | -0.33 | -0.35 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004883 | 糖皮质激素受体的活动 | 助教 | 8621628 | |
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 助教 | 7769088|10903900 | |
| 去:0005496 | 类固醇绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 9079630|10364267|11266503 |12773562 |
|
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006366 | 从RNA聚合酶II启动子转录 | 助教 | 8621628 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 7769088 | |
| 去:0007530 | 性别决定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016568 | 染色质修饰 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 助教 | 9873044 | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 助教 | 9873044 | |
| 去:0005759 | 线粒体基质 | 助教 | 10887960 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 艾达 | - - - - - - | 腺苷脱氨酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9154805 |
| 基于“增大化现实”技术 | AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 | 雄性激素受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9162033 |
| ARPC5 | ARC16 | MGC88523 | dJ127C7.3 | p16-Arc | 肌动蛋白相关蛋白2/3复杂,单元5、16 kda | 2台混合动力 | BioGRID | 10508170 |
| BAG1 | RAP46 | BCL2-associated athanogene | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11101523 |
| CALR | CRT | FLJ26680 | RO | SSA | cC1qR | calreticulin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8107808|9089287 |
| CEBPA | C / EBP-alpha | CEBP | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),α | 重新组成复杂 | BioGRID | 9817600 |
| CEBPA | C / EBP-alpha | CEBP | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),α | - - - - - - | HPRD | 11818365 |
| CEBPB | C / EBP-beta | CRP2 | IL6DBP | |圈MGC32080 | NF-IL6 | TCF5 | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),β | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9817600 |
| COPS6 | CSN6 | MOV34-34KD | COP9本构photomorphogenic同族体亚基6(拟南芥) | - - - - - - | HPRD | 12237292 |
| CREB1 | 分子| MGC9284 | 营反应元件结合蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7621901|8449898 |
| CREBBP | 海关与边境保护局| KAT3A | rst | 结合蛋白分子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9649342 |
| DAP3 | DAP-3 | DKFZp686G12159 | MGC126058 | MGC126059 | MRP-S29 | MRPS29 | bMRP-10 | 死亡相关蛋白3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10903152|12099703 |
| DAXX | BING2 | DAP6 | EAP1 | MGC126245 | MGC126246 | 死亡域相关的蛋白质 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 12595526 |
| 监护系统 | AADC | 二羟基苯丙氨酸脱羧酶(芳香L-amino酸脱羧酶) | 重新组成复杂 | BioGRID | 12864730 |
| DDX54 | DP97 | MGC2835 | 死(Asp-Glu-Ala-Asp)盒子多肽54 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12466272 |
| 儿童早期开发 | GCR2 | HSGT1 | ecdysoneless同族体(果蝇) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9928932 |
| ETS1 | ETS-1 | EWSR2 | FLJ10768 | v-ets E26母红血球病病毒致癌基因同族体1(禽流感) | - - - - - - | HPRD | 11279115 |
| ETS2 | ETS2IT1 | v-ets E26母红血球病病毒致癌基因同族体2(禽流感) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11279115 |
| FKBP4 | FKBP52 | FKBP59 | HBI | Hsp56 | PPIase | p52 | 吸收FK506结合蛋白4,59 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8341706 |
| HMGB1 | DKFZp686A04236 | HMG1 | HMG3 | SBP-1 | 高机动组框1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9671457 |
| HMGB2 | HMG2 | 高机动组框2 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9671457 |
| HNRNPU | HNRPU | SAF-A | U21.1 | 异构核核糖核蛋白U(支架附件因素) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9353307 |
| HOXB1 | HOX2 | HOX2I | hox - 2.9 | MGC116843 | MGC116844 | MGC116845 | 同源框B1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12487626 |
| HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89一半寿命| | LAP2 | 热休克蛋白90 kdaα(胞质),类成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8621522|8645634 |8898375|9334248 |10066374 |
| HSPA1A | FLJ54303 | FLJ54370 | FLJ54392 | FLJ54408 | FLJ75127 | HSP70-1 | HSP70-1A | HSP70I | HSP72 | HSPA1 | HSPA1B | 70 kda热休克蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12093808 |
| HSPD1 | CPN60 | GROEL | HSP60 | HSP65 | HuCHA60 | SPG13 | 60 kda热休克蛋白1 (chaperonin) | 2台混合动力 | BioGRID | 10508170 |
| IDE | FLJ35968 | INSULYSIN | 降解酶 | - - - - - - | HPRD | 8051160 |
| IL1RN | ICIL-1RA | IL-1ra3 | IL1F3 | IL1RA | IRAP | MGC10430 | 白介素1受体拮抗剂 | - - - - - - | HPRD | 10948677 |
| JARID1A | KDM5A | RBBP2 | RBP2 | jumonji,丰富互动领域1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11358960 |
| JARID1A | KDM5A | RBBP2 | RBP2 | jumonji,丰富互动领域1 | Rbp2与GR。这种交互是仿照人类Rbp2和鼠GR证明之间的交互。 | 绑定 | 11358960 |
| 小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | - - - - - - | HPRD | 7823959|8733011 |
| 小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | 重新组成复杂 | BioGRID | 14522952 |
| MED1 | CRSP1 | CRSP200 | DRIP205 | DRIP230 | MGC71488 | PBP | PPARBP | PPARGBP | RB18A | TRAP220 | TRIP2 | 中介复杂的亚基1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10508170|11266503 |
| MED14 | CRSP150 | CRSP2 | CSRP | CXorf4 | DRIP150 | EXLM1 | MGC104513 | RGR1 | TRAP170 | 中介复杂的亚基14 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10508170 |
| NCL | C23 | FLJ45706 | nucleolin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8530516|11162542 |
| NCOA1 | F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 | 核受体共激活剂1 | - - - - - - | HPRD | 12118039|12569182 |12917342 |
| NCOA1 | F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 | 核受体共激活剂1 | 在体外 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 11266503|12118039 |
| NCOA2 | GRIP1 | KAT13C | MGC138808 | NCoA-2 | TIF2 | 核受体共激活剂2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12151000 |
| NCOA2 | GRIP1 | KAT13C | MGC138808 | NCoA-2 | TIF2 | 核受体共激活剂2 | GR-alpha与GRIP1交互。 | 绑定 | 11704662 |
| NCOA3 | ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP | 核受体共激活剂3 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 11266503|12917342 |
| NCOA4 | ARA70 | DKFZp762E1112 | ELE1 | PTC3 | RFG | 核受体共激活剂4 | 2台混合动力 | BioGRID | 10517667 |
| NCOA6 | AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP | 核受体共激活剂6 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10567404 |
| NCOR1 | KIAA1047 | MGC104216 | N-CoR | TRAC1 | hCIT529I10 | hN-CoR | 核受体若1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12011091 |
| NCOR2 | CTG26 | SMRT | SMRTE | SMRTE-tau | TNRC14 | TRAC-1 | TRAC1 | 核受体若2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12011091 |
| NEDD4L | FLJ33870 | KIAA0439 | NEDD4-2 | RSP5 | hNedd4-2 | 神经前体细胞表达,发育抑制4-like | 重新组成复杂 | BioGRID | 9649342 |
| NFKB1 | DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 |施敏原著 | 核因子k光多肽基因增强剂b细胞1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7823959|8290595 |
| NFKB2 | LYT-10 | LYT10 | 核因子k光多肽基因增强剂在b细胞2 (p49 / p100) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7823959 |
| NR2F6 | EAR-2 | EAR2 | ERBAL2 | 核受体亚科2 F组,成员6 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10713182 |
| NR3C1 | GCCR | GCR | GR | GRL | 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) | Co-crystal结构 | BioGRID | 12151000 |
| NR3C2 | MCR | MGC133092 |高| | 核受体亚科3 C组,成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11154266 |
| NRIP1 | FLJ77253 | RIP140 | 核受体相互作用蛋白1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 10364267|11266503 |12773562 |
| NRIP1 | FLJ77253 | RIP140 | 核受体相互作用蛋白1 | - - - - - - | HPRD | 10364267|12773562 |
| ONECUT1 | HNF-6 | HNF6 | HNF6A | 一个削减同源框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10430878 |
| PBX1 | DKFZp686B09108 | MGC126627 | pre-B-cell白血病同源框1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12487626 |
| PELP1 | HMX3 | MNAR | P160 | 脯氨酸、谷氨酸和亮氨酸丰富蛋白质1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12415108 |
| PIAS2 | MGC102682 | MIZ1 | PIASX | PIASX-ALPHA | PIASX-BETA | SIZ2 | ZMIZ4 |捐助 | 蛋白质抑制剂激活统计,2 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11117529 |
| POU1F1 | GHF-1 | PIT1 | Pit-1 | POU类1同源框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9426156 |
| POU2F1 | OCT1 | OTF1 | POU类2同源框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9584182|10480874 |10490647|14522952 |
| POU2F2 | OCT2 | OTF2 | Oct-2 | POU类2同源框2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9584182|10480874 |10490647 |
| PPARGC1A | LEM6 | PGC-1(α)| PGC-1v | PGC1 | PGC1A | PPARGC1 | 过氧物酶体proliferator-activated受体γ,共激活剂1α | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10713165 |
| PRPF6 | 蚂蚁1 | C20orf14汤姆| | u5 - 102 k | hPrp6 | PRP6 pre-mRNA处理因素6同族体(酵母) | - - - - - - | HPRD | 12039962 |
| PSMC3IP | GT198 | HOP2 | HUMGT198A | TBPIP | PSMC3相互作用的蛋白质 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11739747 |
| PTGES3 | P23 | TEBP | cpg | 前列腺素E合酶3(胞质) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10691735 |
| 天车 | ParaT | parathymosin | - - - - - - | HPRD | 10601862 |
| RAD9A | RAD9 | RAD9同族体(s .非洲酒) | 重新组成复杂 | BioGRID | 14966297 |
| RAF1 | CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf | v-raf-1小鼠白血病病毒致癌基因同族体1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11005817 |
| 跑 | ARA24 | Gsp1 | TC4 | 跑,RAS致癌基因家族成员 | 2台混合动力 | BioGRID | 10508170 |
| RANBP9 | RANBPM | 跑结合蛋白9 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 12361945 |
| RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 亲和力Capture-Western 在体外 在活的有机体内 |
BioGRID | 7659084|8290595 |10995388 |
| RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD | 7659084|10995388 |
| SELENBP1 | FLJ13813 | LPSB | SP56 | hSBP | hSP56 | 硒结合蛋白1 | - - - - - - | HPRD | 8157642 |
| SFN | YWHAS | stratifin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12730237 |
| SLC25A4 | 蚂蚁AAC1 | | ANT1 | PEO2 | PEO3 | T1 | 溶质载体家族25(线粒体载体;腺嘌呤核苷转运蛋白),成员4 | - - - - - - | HPRD | 12039962 |
| SMAD3 | DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 | SMAD家庭成员3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10518526|12902338 |
| SMARCA2 | BAF190 | BRM | FLJ36757 | MGC74511 | SNF2 | SNF2L2 | SNF2LA | SWI2 | Sth1p | hBRM | hSNF2a | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8223438 |
| SMARCA4 | BAF190 |缺失| FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员4 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 10688647|12917342 |
| SMARCB1 | BAF47 | INI1 | RDT | SNF5 | SNF5L1 | Sfh1p | Snr1 | hSNFS | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚b,成员1 | - - - - - - | HPRD | 10688647 |
| SMARCC1 | BAF155 | CRACC1 | Rsc8 | SRG3 | SWI3 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚c,成员1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12917342 |
| SMARCD1 | BAF60A | CRACD1 | Rsc6p | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚d,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12917342 |
| SMARCE1 | BAF57 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚e,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12917342 |
| STAT3 | APRF | FLJ20882 |麻疹| MGC16063 | 信号传感器和转录激活3(急性期反应的因素) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9388192|14522952 |
| STAT5A | MGF | STAT5 | 信号传感器和5的转录激活 | - - - - - - | HPRD | 9528750 |
| STAT5B | STAT5 | 信号传感器和激活转录5 b | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8878484|9528750 |11158330 |
| SUMO1 | DAP-1 | GMP1 | OFC10 | PIC1 | SENP2 | SMT3 | SMT3C | SMT3H3 | SUMO-1 | UBL1 | SMT3 mif抑制两个3同族体1(酵母) | - - - - - - | HPRD | 12193561 |
| SVIL | DKFZp686A17191 | supervillin | 2台混合动力 | BioGRID | 11792840 |
| TADA2L | ADA2 | ADA2A | FLJ12705 | KL04P | hADA2 | 转录适配器2 (ADA2同系物、酵母)的地方 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9649342 |
| 真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9649342 |
| 隔离 | - - - - - - | thymine-DNA糖基化酶 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12874288 |
| TGFB1I1 | ARA55 | HIC-5 | HIC5 | TSC-5 | 转化生长因子β1诱导成绩单1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10848625 |
| TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白质p53 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11080152 |
| TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白质p53 | p53与GR。这种交互是仿照了互动p53从物种和GR不详不详的物种。 | 绑定 | 9215863 |
| TRIM24 | PTC6 | RNF82 | TF1A | TIF1 | TIF1A | TIF1ALPHA | hTIF1 | 三方motif-containing 24 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9115274 |
| TRIM28 | FLJ29029 | KAP1 | RNF96 | TF1B | TIF1B | 三方motif-containing 28 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9742105 |
| TSG101 | TSG10 | VPS23 | 肿瘤易感性基因101 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10508170 |
| 时候 | DKFZp686B1993 | MGC61975 | TRX | TRX1 | 硫氧还蛋白 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9915858 |
| UBE2I | C358B7.1 | P18 | UBC9 | ubiquitin-conjugating酶E2I (UBC9同系物、酵母) | - - - - - - | HPRD | 11812797 |
| YWHAH | YWHA1 | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,埃塔多肽 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9079630|11266503 |12730237 |
| ZBTB16 | PLZF | ZNF145 | 锌指和BTB域包含16 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 14521715 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA GCR通路 | 22 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA NTHI通路 | 24 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID SMAD2 3核通路 | 82年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID HDAC CLASSII通路 | 34 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID HNF3B通路 | 45 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID REG GR通路 | 82年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID AR TF通路 | 53 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID AP1通路 | 70年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME BMAL1时钟NPAS2激活生理表现 | 36 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME核受体转录途径 | 49 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME生物钟 | 53 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过CD40 HOLLMANN细胞凋亡 | 201年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI PAX FOXO1融合的目标 | 255年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN | 460年 | 312年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HORIUCHI WTAP目标了 | 306年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VECCHI胃癌早期DN | 367年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萨瓦特结直肠腺瘤DN | 291年 | 176年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇缺氧了 | 171年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇DMOG缺氧的 | 130年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇HIF1A DN的目标 | 91年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHEBOTAEV GR目标了 | 77年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VANHARANTA子宫肌瘤DN | 67年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标 | 191年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BUSA SAM68目标了 | 7 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王HCP前列腺癌 | 111年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 英格拉姆嘘目标了 | 127年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GUENTHER增长球形VS附着DN | 26 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沃顿RUNX DN的目标 | 29日 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROZANOV MMP14目标子集 | 33 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROZANOV MMP14相关 | 11 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROZANOV MMP14目标了 | 266年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTROEM与IL5 DN | 64年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 彭谷氨酰胺剥夺了 | 38 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRANDVAUX IRF3目标了 | 15 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肿瘤对胎儿肾脏1 | 182年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 詹V2后期分化的基因 | 45 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃成熟造血细胞 | 293年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡 | 314年 | 201年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染10小时血巨细胞病毒DN | 56 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SESTO应对紫外线C2 | 54 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伦纳德缺氧 | 47 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 朱巨细胞病毒8小时DN | 53 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 朱巨细胞病毒24小时DN | 91年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 犹太人的紫外响应集群D7 | 40 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人紫外线高剂量DN | 312年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WELCSH BRCA1目标了 | 198年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 朱巨细胞病毒所有DN | 128年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯顿脂肪形成11 | 57 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BAELDE糖尿病肾病DN | 434年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 集群G6 DAZARD紫外线反应 | 153年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒6小时DN | 160年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 《图片报》CTNNB1致癌签名 | 82年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩斯在结肠癌DN甲基化 | 28 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑FOXP3在胸腺的目标 | 196年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 巨噬细胞培养宽容DN | 409年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化DN | 281年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1目标了 | 673年 | 430年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 安布罗西尼FLAVOPIRIDOL治疗TP53 | 109年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌DN | 101年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 冬天缺氧METAGENE | 242年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究人类MITODB 6 2002 | 429年 | 260年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究线粒体 | 447年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌好生存A4 | 196年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1 DN的目标 | 442年 | 275年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和发票16易位 | 422年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZEMBUTSU对长春花碱的敏感性 | 18 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G2 | 182年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DUTERTRE雌二醇反应6小时DN | 91年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 肿瘤抑制SMAD1和穿SMAD5 | 134年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MIYAGAWA EWSR1 ETS融合DN的目标 | 229年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TORCHIA EWSR1 FLI1融合DN的目标 | 321年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 冯氏TNF通过P38完成响应 | 227年 | 151年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 124.1 | 2 | 9 | 1、m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA | ||||
| miR-124/506 | 20. | 26 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA | ||||
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA | ||||
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 142 - 3 - p | 135年 | 141年 | 1 | hsa - mir - 142 - 3 - p | UGUAGUGUUUCCUACUUUAUGGA |
| mir - 142 - 5 - p | 531年 | 537年 | 1 | hsa - mir - 142 - 5 - p | CAUAAAGUAGAAAGCACUAC |
| miR-18 | 1378年 | 1385年 | 1、m8 | hsa-miR-18a | UAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUA |
| hsa-miR-18b | UAAGGUGCAUCUAGUGCAGUUA | ||||
| mir - 181 | 2254年 | 2260年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| mir - 183 | 1287年 | 1294年 | 1、m8 | hsa - mir - 183 | UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG |
| mir - 200 bc / 429 | 739年 | 745年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| miR-204/211 | 480年 | 487年 | 1、m8 | hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU |
| hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
| hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU | ||||
| hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
| mir - 218 | 2501年 | 2507年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| miR-22 | 611年 | 618年 | 1、m8 | hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU |
| miR-30-3p | 1480年 | 1487年 | 1、m8 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| miR-30-5p | 460年 | 466年 | 1 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir - 328 | 154年 | 161年 | 1、m8 | hsa - mir - 328大脑 | CUGGCCCUCUCUGCCCUUCCGU |
| mir - 377 | 663年 | 670年 | 1、m8 | hsa - mir - 377 | AUCACACAAAGGCAACUUUUGU |
| mir - 410 | 1687年 | 1694年 | 1、m8 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 496 | 2135年 | 2141年 | 1 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |
| mir - 543 | 2255年 | 2262年 | 1、m8 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |