概括
基因 29108
象征 Pycard
同义词 ASC | Card5 | TMS | TMS-1 | TMS1
描述 PYD和卡域包含
参考 MIM:606838|HGNC:HGNC:16608|ENSEMBL:ENSG00000103490|HPRD:06020|Vega:Otthumg00000176753
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p11.2
Pascal P值 0.27
Sherlock P值 0.274
TADA P值 0.009
胎儿β -1.215
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
Pycard CHR16 31213117 一个 C NM_013258
NM_145182
p.126v> g
p.107v> g
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12019269
去:0004197 半胱氨酸型内肽酶活性 IEA -
去:0008656 caspase激活剂活性 nas 12019269
GO:0032090 吡啶结构域结合 IPI 15030775
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 15030775
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0006917 诱导凋亡 塔斯 10567338
去:0007165 信号转导 nas 12019269
去:0006954 炎症反应 IEA -
去:0006919 caspase激活 nas 12019269
GO:0033209 肿瘤坏死因子介导的信号通路 艾达 12656673
去:0051092 NF-kappab转录因子活性的正调控 艾达 12656673
去:0050718 白介素-1 beta分泌的积极调节 艾达 15030775
GO:0045786 细胞周期的负调控 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 IEA -
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 nas 12019269
去:0008385 ikappab激酶复合体 塔斯 12656673

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg点头喜欢受体信号通路 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胞质DNA感应途径 56 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NLRP3炎性体 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组炎症 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOJIMA SFRP2靶向DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
furukawa dusp6靶向pci35 74 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger甲基化的癌症 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成人癌中甲基化的欧姆 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML带有MLL融合 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LSD1目标 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC和MBD2的Phesse目标 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Glis2靶向 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因