基因页:Pycard
概括?
基因 | 29108 |
象征 | Pycard |
同义词 | ASC | Card5 | TMS | TMS-1 | TMS1 |
描述 | PYD和卡域包含 |
参考 | MIM:606838|HGNC:HGNC:16608|ENSEMBL:ENSG00000103490|HPRD:06020|Vega:Otthumg00000176753 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p11.2 |
Pascal P值 | 0.27 |
Sherlock P值 | 0.274 |
TADA P值 | 0.009 |
胎儿β | -1.215 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Pycard | CHR16 | 31213117 | 一个 | C | NM_013258 NM_145182 |
p.126v> g p.107v> g |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PYCARD_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12019269 | |
去:0004197 | 半胱氨酸型内肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008656 | caspase激活剂活性 | nas | 12019269 | |
GO:0032090 | 吡啶结构域结合 | IPI | 15030775 | |
GO:0042803 | 蛋白质同构化活性 | 艾达 | 15030775 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
去:0006917 | 诱导凋亡 | 塔斯 | 10567338 | |
去:0007165 | 信号转导 | nas | 12019269 | |
去:0006954 | 炎症反应 | IEA | - | |
去:0006919 | caspase激活 | nas | 12019269 | |
GO:0033209 | 肿瘤坏死因子介导的信号通路 | 艾达 | 12656673 | |
去:0051092 | NF-kappab转录因子活性的正调控 | 艾达 | 12656673 | |
去:0050718 | 白介素-1 beta分泌的积极调节 | 艾达 | 15030775 | |
GO:0045786 | 细胞周期的负调控 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | nas | 12019269 | |
去:0008385 | ikappab激酶复合体 | 塔斯 | 12656673 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg点头喜欢受体信号通路 | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg胞质DNA感应途径 | 56 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NLRP3炎性体 | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组炎症 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NOJIMA SFRP2靶向DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
furukawa dusp6靶向pci35 | 74 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
成人癌中甲基化的欧姆 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血中间祖先 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LSD1目标 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APC和MBD2的Phesse目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Glis2靶向 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |