基因页:mylip
Summary?
GeneID | 29116 |
象征 | mylip |
同义词 | IDOL|MIR |
描述 | 肌球蛋白调节轻链相互作用蛋白 |
参考 | MIM:610082|HGNC:HGNC:21155|Ensembl:ENSG00000007944|HPRD:17621|Vega:Otthumg0000000016405 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.3 |
Pascal P值 | 0.241 |
胎儿β | -0.59 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0159 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYLIP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0004842 | 泛素 - 蛋白连接酶活性 | 艾达 | 14550572 | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0008092 | 细胞骨架蛋白结合 | 艾达 | 10593918 | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 小鬼 | 神经突(GO期限:5) | 10593918 |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0006928 | 细胞运动 | 小鬼 | 10593918 | |
GO:0016567 | 蛋白质泛素化 | 艾达 | 14550572 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | 艾达 | 10593918 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0019898 | 外膜到膜 | IEA | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 1271 | 1278 | 1A,M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 1271 | 1277 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 1236 | 1242 | 1a | HSA-MIR-17-5P | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-19 | 1310 | 1317 | 1A,M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
mir-221/222 | 1278 | 1285 | 1A,M8 | hsa-miR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
hsa-miR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
mir-224 | 562 | 568 | M8 | hsa-miR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
mir-25/32/92/363/367 | 1196 | 1203 | 1A,M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
HSA-MIR-367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
mir-323 | 1287 | 1293 | M8 | HSA-MIR-323脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
miR-365 | 1128 | 1134 | M8 | HSA-MIR-365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
mir-410 | 1440 | 1446 | M8 | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
mir-455 | 1354 | 1361 | 1A,M8 | HSA-MIR-455 | Uaugugccuuuggacuacaucg |
miR-494 | 1418 | 1424 | M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |
mir-500 | 1195 | 1201 | 1a | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |