基因页：GRM5
概括？
| 基因 | 2915 |
| 象征 | GRM5 |
| 同义词 | gprc1e | mglur5 | ppp1r86 | mglu5 |
| 描述 | 谷氨酸受体，代谢5 |
| 参考 | MIM：604102|HGNC：HGNC：4597|ENSEMBL：ENSG00000168959| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11 Q14.3 |
| Pascal P值 | 0.154 |
| 胎儿β | -0.473 |
| 支持 | GPCR信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_MGLUR5 G2CDB.HUMANNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.104 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 3月6日 | 0.95 | 0.97 |
| kif1b | 0.95 | 0.96 |
| KIAA1219 | 0.95 | 0.96 |
| PCNX | 0.95 | 0.96 |
| dennd5b | 0.95 | 0.96 |
| PUM2 | 0.94 | 0.96 |
| AP1G1 | 0.94 | 0.96 |
| WHSC1L1 | 0.94 | 0.96 |
| dyrk1a | 0.94 | 0.96 |
| AVL9 | 0.94 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.75 | -0.84 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.83 |
| MT-CO2 | -0.72 | -0.84 |
| higd1b | -0.72 | -0.84 |
| HSD17B14 | -0.71 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.70 | -0.79 |
| TLCD1 | -0.70 | -0.79 |
| AC021016.1 | -0.70 | -0.79 |
| TSC22D4 | -0.70 | -0.75 |
| mt-cyb | -0.70 | -0.80 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 7908515 |
| 去：0007206 | 代谢性谷氨酸受体，磷脂酶C激活途径 | 塔斯 | 谷氨酸（GO期限：10） | 7908515 |
| 去：0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7908515 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg长期增强 | 70 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai慢性肝炎与肝癌DN | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染30分钟DN | 150 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-133 | 460 | 467 | 1A，M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-181 | 428 | 435 | 1A，M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-182 | 774 | 780 | M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-30-5p | 381 | 387 | M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-330 | 294 | 300 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-493-5p | 431 | 437 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |