基因页:CXCL3
概括?
基因 | 2921 |
象征 | CXCL3 |
同义词 | CINC-2B | GRO3 | grog | MIP-2B | MIP2B | SCYB3 |
描述 | C-X-C序列趋化因子配体3 |
参考 | MIM:139111|HGNC:HGNC:4604|ENSEMBL:ENSG00000163734|HPRD:00742|Vega:Otthumg00000160861 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q21 |
Pascal P值 | 0.287 |
胎儿β | 0.187 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01897562 | 4 | 74904675 | CXCL3 | 2.37E-8 | -0.022 | 7.79E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | CXCL3 | 2921 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组趋化因子受体结合趋化因子 | 57 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长MTOR信号传导DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色 | 136 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与CML分裂 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML划分与正常静止DN | 95 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham正常静止与正常分裂 | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Barretts食道和食道癌 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌的进展 | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahadevan对MP470的响应 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应40 MCF10A | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标3 DN | 59 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西葫芦转移DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sana tnf发出信号 | 83 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HALMOS CEBPA目标 | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤上的theilgaard中性粒细胞 | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
铃木对TSA和Decitabine 1B的反应 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahajan对IL1A的回应 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G2 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild HRAS致癌特征 | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaurnier PSMD4目标 | 73 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng IL22发出信号 | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
法拉利对fenretinide的反应 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 | 91 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
cro骨基质刺激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tian tnf通过NFKB信令 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G28 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dasu IL6信号向上 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染2小时 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong TNF靶向 | 63 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38部分的phong TNF响应 | 160 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi直接辐照 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi旁观者辐照 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |