概括
基因 2931
象征 GSK3A
同义词 -
描述 糖原合酶激酶3α
参考 MIM:606784|HGNC:HGNC:4616|ENSEMBL:ENSG00000105723|HPRD:06002|Vega:Otthumg00000150722
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.14
胎儿β -0.343

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0971

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HHLA3 0.83 0.83
tecr 0.77 0.78
HSPB8 0.77 0.81
GM2A 0.76 0.78
SLC48A1 0.76 0.78
PPAP2A 0.76 0.80
gnptg 0.75 0.79
SLC25A45 0.75 0.76
C5orf32 0.75 0.81
fhit 0.75 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1949 -0.61 -0.57
ZNF551 -0.60 -0.53
AC004017.1 -0.60 -0.52
tubb2b -0.60 -0.56
ZBTB8A -0.59 -0.49
ISLR2 -0.59 -0.45
nkiras2 -0.59 -0.51
ZNF300 -0.59 -0.53
CHD3 -0.59 -0.51
PHF14 -0.58 -0.62

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0050321 tau蛋白激酶活性 IEA 大脑(GO期限:7) -
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 8524413

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Ptdins途径 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG PIP3在心脏肌周期中发出信号 67 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B型膜片中的SIG IL4受体 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wnt信令 89 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
心肌细胞中的SIG胰岛素受体途径 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG BCR信号通路 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
st wnt beta catenin途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST磷酸肌醇3激酶途径 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta catenin deg途径 18 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid wnt典型途径 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXM1途径 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid pi3kci akt途径 35 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCF套件的Reactome信号传导 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4信号中的Reactome PI3K事件 38 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2信号中的Reactome PI3K事件 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K AKT激活 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Akt磷酸化靶标在细胞质中 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GAB1信号体 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游信号转导 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XBP1对伴侣基因的反应组激活 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi 3K级联 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pip3激活Akt信号传导 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM对TSA和Decitabine DN的反应 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C0的反应 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因