基因页:GSR
Summary?
基因ID | 2936 |
象征 | GSR |
同义词 | HEL-75 | HEL-S-122M |
描述 | 谷胱甘肽还原酶 |
参考 | MIM:138300|HGNC:HGNC:4623|ENSEMBL:ENSG00000104687|HPRD:00704|Vega:Otthumg00000163946 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p21.1 |
Pascal P值 | 0.248 |
Sherlock P值 | 0.093 |
胎儿β | -0.227 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 Frontal Cortex BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03086 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.00057 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg07077080 | 8 | 30585289 | GSR | 4.096E-4 | -0.364 | 0.044 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12677942 | CHR8 | 31539941 | GSR | 2936 | 0.02 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GSR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GSTT2B | 0.89 | 0.85 |
ACY1 | 0.63 | 0.57 |
GCAT | 0.63 | 0.57 |
AC138647.1 | 0.62 | 0.54 |
SDSL | 0.61 | 0.50 |
TNFSF12 | 0.61 | 0.57 |
FAM108A4 | 0.61 | 0.56 |
LRRC29 | 0.61 | 0.54 |
TMEM54 | 0.61 | 0.59 |
ACBD4 | 0.61 | 0.53 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PHF14 | -0.45 | -0.49 |
SFRS12 | -0.44 | -0.46 |
RTF1 | -0.43 | -0.45 |
EIF5B | -0.43 | -0.51 |
UPF2 | -0.41 | -0.40 |
BAT2D1 | -0.41 | -0.39 |
thoc2 | -0.40 | -0.44 |
UPF3B | -0.40 | -0.46 |
NOVA1 | -0.39 | -0.43 |
RBM25 | -0.39 | -0.41 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004362 | 谷胱甘肽 - 硫化物还原酶活性 | EXP | 947404 | |
去:0004362 | 谷胱甘肽 - 硫化物还原酶活性 | 塔斯 | 947404 | |
去:0009055 | 电子载体活动 | 塔斯 | 947404 | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
GO:0050660 | 时尚结合 | IEA | - | |
去:0050661 | NADP结合 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006749 | glutathione metabolic process | IEA | - | |
GO:0045454 | 细胞氧化还原稳态 | IEA | - | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | EXP | 947404 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - |