Summary
基因ID 2936
象征 GSR
同义词 HEL-75 | HEL-S-122M
描述 谷胱甘肽还原酶
参考 MIM:138300|HGNC:HGNC:4623|ENSEMBL:ENSG00000104687|HPRD:00704|Vega:Otthumg00000163946
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p21.1
Pascal P值 0.248
Sherlock P值 0.093
胎儿β -0.227
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
皮质
Frontal Cortex BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
cg07077080 8 30585289 GSR 4.096E-4 -0.364 0.044 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12677942 CHR8 31539941 GSR 2936 0.02 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GSTT2B 0.89 0.85
ACY1 0.63 0.57
GCAT 0.63 0.57
AC138647.1 0.62 0.54
SDSL 0.61 0.50
TNFSF12 0.61 0.57
FAM108A4 0.61 0.56
LRRC29 0.61 0.54
TMEM54 0.61 0.59
ACBD4 0.61 0.53
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PHF14 -0.45 -0.49
SFRS12 -0.44 -0.46
RTF1 -0.43 -0.45
EIF5B -0.43 -0.51
UPF2 -0.41 -0.40
BAT2D1 -0.41 -0.39
thoc2 -0.40 -0.44
UPF3B -0.40 -0.46
NOVA1 -0.39 -0.43
RBM25 -0.39 -0.41

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004362 谷胱甘肽 - 硫化物还原酶活性 EXP 947404
去:0004362 谷胱甘肽 - 硫化物还原酶活性 塔斯 947404
去:0009055 电子载体活动 塔斯 947404
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
GO:0050660 时尚结合 IEA -
去:0050661 NADP结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006749 glutathione metabolic process IEA -
GO:0045454 细胞氧化还原稳态 IEA -
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 EXP 947404
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005739 线粒体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg谷胱甘肽代谢 50 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA FREE PATHWAY 10 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
核苷酸的反应组代谢 72 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
核苷酸DI和三磷酸的反应组合成和互转换 19 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向 457 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时DN 75 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARKEY RB1 CHRONIC LOF UP 115 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
环氧化物素的浓凋亡 239 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
曼恩对amifostine的反应 20 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JAZAG TGFB1信号ING UP 108 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOUSTIS ROS 36 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
尼尔森对雄激素的反应 86 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu IL4信号传导 94 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染18小时 178 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成6 189 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YANG MUC2靶标十二指肠6mo 10 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SINGH NFE2L2 TARGETS 15 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄线粒体基因模块 217 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MOOTHA HUMAN MITODB 6 2002 429 260 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF的反应 418 282 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
德拉克洛瓦RAR目标了 48 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delacroix Rar Bound ES 462 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway