基因页:GSTM1
概括?
基因 | 2944 |
象征 | GSTM1 |
同义词 | GST1 | GSTM1-1 | GSTM1A-1A | GSTM1B-1B | GTH4 | GTM1 | H-B | MU | MU-1 |
描述 | 谷胱甘肽S-转移酶MU 1 |
参考 | MIM:138350|HGNC:HGNC:4632|ENSEMBL:ENSG00000134184|HPRD:00707|Vega:Otthumg0000000011635 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p13.3 |
Pascal P值 | 0.219 |
Sherlock P值 | 0.441 |
胎儿β | -0.692 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9812308 | CHR3 | 1378230 | GSTM1 | 2944 | 0.15 | 反式 | ||
RS138895896 | 1 | 110267677 | GSTM1 | ENSG00000134184.8 | 6.46696E-7 | 0.02 | 37241 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GSTM1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CCT8 | 0.93 | 0.95 |
RSL1D1 | 0.92 | 0.93 |
CCT2 | 0.92 | 0.94 |
SMNDC1 | 0.92 | 0.90 |
zufsp | 0.92 | 0.94 |
Tex10 | 0.91 | 0.92 |
polr1d | 0.91 | 0.91 |
TAF7 | 0.91 | 0.93 |
C9orf30 | 0.91 | 0.92 |
TCP1 | 0.91 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.72 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.88 |
MT-CO2 | -0.72 | -0.87 |
AF347015.31 | -0.72 | -0.86 |
mt-cyb | -0.71 | -0.88 |
AF347015.8 | -0.71 | -0.88 |
AF347015.15 | -0.70 | -0.89 |
HLA-F | -0.70 | -0.81 |
AF347015.2 | -0.69 | -0.90 |
tinagl1 | -0.68 | -0.80 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004364 | 谷胱甘肽转移酶活性 | IEA | - | |
去:0004364 | 谷胱甘肽转移酶活性 | 塔斯 | 8403204 | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg谷胱甘肽代谢 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢细胞色素P450 | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB途径 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome谷胱甘肽结合 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN | 153 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche乳头状瘤进度风险 | 74 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约翰逊脑癌早期与晚期DN | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GON GON BLOOD HDL胆固醇QTL顺式 | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc Up | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc TGFA UP | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer E2F1 UP | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1的赫斯目标 | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张增殖与静止 | 51 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weng Por靶向肝脏 | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成9 | 92 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 | 77 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG MUC2靶标十二指肠3MO DN | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG MUC2靶标十二指肠6MO DN | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级转移DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe Wnt3a靶向 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向DN | 108 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |