基因页:GTF2A1
概括?
基因 | 2957 |
象征 | GTF2A1 |
同义词 | tf2a1 | tfiia | tfiia-42 | tfiial |
描述 | 一般转录因子IIA 1 |
参考 | MIM:600520|HGNC:HGNC:4646|ENSEMBL:ENSG00000165417|HPRD:02748|Vega:Otthumg00000171414 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q31.1 |
Pascal P值 | 1.001E-5 |
胎儿β | 0.547 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GTF2A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Bcl3 | bcl4 |D19S37 | B细胞CLL/淋巴瘤3 | - | HPRD,Biogrid | 9812988 |
GTF2A2 | HST18745 |TF2A2 |tfiia | 通用转录因子IIA,2,12KDA | - | HPRD | 7724559|7958900 |
GTF2B | TF2B |tfiib | 通用转录因子IIB | - | HPRD | 1876184 |
GTF2E1 | fe |TF2E1 |tfiie-a | 通用转录因子IIE,多肽1,α56KDA | - | HPRD,Biogrid | 11509574 |
GTF2E2 | fe |TF2E2 |tfiie-b | 通用转录因子IIE,多肽2,Beta 34KDA | - | HPRD,Biogrid | 9618479|11509574 |
GTF2F1 | BTF4 |Rap74 |TF2F1 |tfiif | 通用转录因子IIF,多肽1,74KDA | - | HPRD,Biogrid | 11509574 |
HMGB1 | DKFZP686A04236 |HMG1 |HMG3 |SBP-1 | 高机动性组框1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9880542 |
NCOA6 | AIB3 |antp |ASC2 |HOX1.1 |Hoxa7 |KIAA0181 |NRC |prip |Rap250 |trbp | 核受体共激活因子6 | 重构的复合物 | Biogrid | 10567404 |
TAF1 | Ba2r |CCG1 |CCGS |dyt3 |kat4 |N-TAF1 |NSCL2 ||P250 |taf2a | TAFII250 | TAF1 RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,250KDA | - | HPRD,Biogrid | 11278496 |
TAF4 | FLJ41943 |taf2c |taf2c1 |taf4a |tafii130 |TAFII135 | TAF4 RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,135KDA | - | HPRD | 11564872 |
taf4b | taf2c2 |TAFII105 | TAF4B RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,105KDA | TAF4B(HTAF12B)与GTF2A1(TFIIA)相互作用。 | 绑定 | 15601843 |
TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | 生化活动 重构的复合物 |
Biogrid | 7724559|7958900 |9603936|11278496 |11509574 |
TBPL1 | MGC:8389 |MGC:9620 |螺栓|TLF |TLP |TRF2 | 类似于TBP的1 | - | HPRD,Biogrid | 10570139 |
Trip4 | HST17391 | 甲状腺激素受体相互作用4 | - | HPRD | 10454579 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg基础转录因子 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Carm er途径 | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta rarrxr途径 | 15 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol II转录 | 105 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA POL II转录启动和启动子开口 | 41 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol II前转录事件 | 61 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成12 | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1 | 125 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇2向上 | 54 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇4 | 112 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇5 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |