概括
基因 2957
象征 GTF2A1
同义词 tf2a1 | tfiia | tfiia-42 | tfiial
描述 一般转录因子IIA 1
参考 MIM:600520|HGNC:HGNC:4646|ENSEMBL:ENSG00000165417|HPRD:02748|Vega:Otthumg00000171414
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q31.1
Pascal P值 1.001E-5
胎儿β 0.547

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Bcl3 bcl4 |D19S37 B细胞CLL/淋巴瘤3 - HPRD,Biogrid 9812988
GTF2A2 HST18745 |TF2A2 |tfiia 通用转录因子IIA,2,12KDA - HPRD 7724559|7958900
GTF2B TF2B |tfiib 通用转录因子IIB - HPRD 1876184
GTF2E1 fe |TF2E1 |tfiie-a 通用转录因子IIE,多肽1,α56KDA - HPRD,Biogrid 11509574
GTF2E2 fe |TF2E2 |tfiie-b 通用转录因子IIE,多肽2,Beta 34KDA - HPRD,Biogrid 9618479|11509574
GTF2F1 BTF4 |Rap74 |TF2F1 |tfiif 通用转录因子IIF,多肽1,74KDA - HPRD,Biogrid 11509574
HMGB1 DKFZP686A04236 |HMG1 |HMG3 |SBP-1 高机动性组框1 重构的复合物 Biogrid 9880542
NCOA6 AIB3 |antp |ASC2 |HOX1.1 |Hoxa7 |KIAA0181 |NRC |prip |Rap250 |trbp 核受体共激活因子6 重构的复合物 Biogrid 10567404
TAF1 Ba2r |CCG1 |CCGS |dyt3 |kat4 |N-TAF1 |NSCL2 ||P250 |taf2a | TAFII250 TAF1 RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,250KDA - HPRD,Biogrid 11278496
TAF4 FLJ41943 |taf2c |taf2c1 |taf4a |tafii130 |TAFII135 TAF4 RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,135KDA - HPRD 11564872
taf4b taf2c2 |TAFII105 TAF4B RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,105KDA TAF4B(HTAF12B)与GTF2A1(TFIIA)相互作用。 绑定 15601843
TBP gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid 塔塔盒结合蛋白 生化活动
重构的复合物
Biogrid 7724559|7958900
|9603936|11278496
|11509574
TBPL1 MGC:8389 |MGC:9620 |螺栓|TLF |TLP |TRF2 类似于TBP的1 - HPRD,Biogrid 10570139
Trip4 HST17391 甲状腺激素受体相互作用4 - HPRD 10454579


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg基础转录因子 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Carm er途径 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta rarrxr途径 15 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol II转录 105 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA POL II转录启动和启动子开口 41 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol II前转录事件 61 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期 125 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期的后期 104 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成12 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 125 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇2向上 54 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇4 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇5 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因