基因页面:GTF2E2
总结吗?
| GeneID | 2961年 |
| 象征 | GTF2E2 |
| 同义词 | 菲| TF2E2 | TFIIE-B |
| 描述 | 通用转录因子国际教育协会亚基2 |
| 参考 | MIM: 189964|HGNC: HGNC: 4651|运用:ENSG00000197265|HPRD: 01800|织女:OTTHUMG00000163934 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.331 |
| 夏洛克假定值 | 0.121 |
| 胎儿β | 0.535 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.03086 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg18356330 | 8 | 30515990 | GTF2E2 | -0.021 | 0.28 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs423974 | chr16 | 77930523 | GTF2E2 | 2961年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SMARCD3 | 0.74 | 0.75 |
| CDKN2D | 0.74 | 0.72 |
| ETNK2 | 0.74 | 0.76 |
| FKBP1B | 0.74 | 0.76 |
| RNF7 | 0.72 | 0.74 |
| VPS25 | 0.71 | 0.71 |
| CHID1 | 0.70 | 0.73 |
| C1orf59 | 0.69 | 0.71 |
| CHCHD6 | 0.68 | 0.71 |
| GNB2 | 0.68 | 0.73 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.2 | -0.52 | -0.56 |
| MT-CO2 | -0.50 | -0.53 |
| AF347015.8 | -0.50 | -0.54 |
| AF347015.26 | -0.50 | -0.56 |
| AF347015.15 | -0.50 | -0.54 |
| AF347015.33 | -0.49 | -0.54 |
| MT-CYB | -0.49 | -0.54 |
| AF347015.27 | -0.48 | -0.54 |
| AF347015.31 | -0.47 | -0.50 |
| AF347015.9 | -0.46 | -0.53 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003702 | RNA聚合酶II转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 艾达 | 9271120 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 7926747|8999876|9271120 |
|
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 经验值 | 8946909 | |
| 去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 助教 | 1956398 | |
| 去:0006368 | RNA RNA聚合酶II发起人的伸长 | 经验值 | 9405375 | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005654 | 核浆 | 经验值 | 1939271|2449431|8946909 |
|
| 去:0005673 | 转录因子TFIIE复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ATF7IP | FLJ10139 | FLJ10688 | MCAF | p621 | 7激活转录因子相互作用的蛋白质 | - - - - - - | HPRD | 10777215 |
| ERCC3 | BTF2 | GTF2H | RAD25 | TFIIH | XPB | 切除修复cross-complementing啮齿动物修复缺陷,互补群3(着色性干皮病B组补充) | 重新组成复杂 | BioGRID | 7926747 |
| ERCC6 | ARMD5 | CKN2 |咖啡| COFS1 | CSB | RAD26 | 切除修复cross-complementing啮齿动物修复缺陷,互补群6 | - - - - - - | HPRD | 8999876 |
| ”丛书 | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 | 重新组成复杂 | BioGRID | 8628277 |
| GTF2A1 | MGC129969 | MGC129970 | TF2A1 | TFIIA | 通用转录因子活动花絮,1,19/37kDa | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9618479|11509574 |
| GTF2B | TF2B | TFIIB | IIB通用转录因子 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 11113176|12665589 |
| GTF2E1 | 菲| TF2E1 | TFIIE-A | 通用转录因子国际教育协会多肽1α56 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9677423|11113176 |12665589 |
| GTF2E2 | 菲| TF2E2 | TFIIE-B | 通用转录因子国际教育协会,多肽2,β34 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 9677423 |
| GTF2F1 | BTF4 | RAP74 | TF2F1 | TFIIF | 通用转录因子IIF多肽74 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 9677423|11113176 |
| GTF2F2 | BTF4 | RAP30 | TF2F2 | TFIIF | 通用转录因子IIF多肽2、30 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 11113176 |
| 小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | 重新组成复杂 | BioGRID | 8628277 |
| KLF5 | BTEB2 | CKLF | IKLF | Kruppel-like因子5(肠) | - - - - - - | HPRD | 9089417 |
| MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | - - - - - - | HPRD | 9271120 |
| POLR2A | MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 | DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12665589 |
| SND1 | TDRD11 | p100 | 葡萄球菌核酸酶和都铎域包含1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7651391 |
| 真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9677423|11113176 |
| XPA | XP1 | XPAC | 着色性干皮病,互补群 | 重新组成复杂 | BioGRID | 7876263 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG基底转录因子 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RNA聚合酶II转录 | 105年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RNA聚合酶II转录前启动和启动子 | 41 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME转录 | 210年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RNA聚合酶II PRE转录事件 | 61年 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME艾滋病毒感染 | 207年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME艾滋病毒生命周期 | 125年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME艾滋病毒生命周期的后期阶段 | 104年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SILIGAN EWS FLI1融合DN的目标 | 18 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE皮肤肿瘤促进剂DN | 185年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险低的DN | 165年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险高的DN | 180年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE鳞状细胞癌DN | 181年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOLUB所有AML VS | 24 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 史密斯叔目标了 | 145年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 贝克他莫昔芬耐了 | 50 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STEARMAN肺癌早期和晚期 | 125年 | 89年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RIZKI肿瘤侵袭性的3 d | 210年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LINDSTEDT树突状细胞成熟C | 69年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AGUIRRE胰腺癌拷贝数DN | 238年 | 145年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 气缺氧 | 140年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-30-5p | 121年 | 127年 | 1 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||