基因页：GTF2H1
概括？
| 基因 | 2965 |
| 象征 | GTF2H1 |
| 同义词 | btf2 | p62 | tfb1 | tfiih |
| 描述 | 一般转录因子IIH亚基1 |
| 参考 | MIM：189972|HGNC：HGNC：4655|ENSEMBL：ENSG00000110768|HPRD：01807|Vega：Otthumg00000167690 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11P15.1-P14 |
| Pascal P值 | 0.352 |
| Sherlock P值 | 0.677 |
| 胎儿β | 0.532 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6025385 | CHR20 | 55703712 | GTF2H1 | 2965 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Sertad4 | 0.82 | 0.63 |
| LAMC2 | 0.82 | 0.58 |
| FOXO1 | 0.81 | 0.34 |
| TSPAN9 | 0.80 | 0.56 |
| FAM40B | 0.80 | 0.17 |
| FOXP1 | 0.79 | 0.78 |
| NCOA1 | 0.79 | 0.78 |
| p2ry1 | 0.78 | 0.15 |
| RYBP | 0.77 | 0.83 |
| C13orf29 | 0.76 | 0.32 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.45 | -0.67 |
| AF347015.31 | -0.44 | -0.66 |
| MT-CO2 | -0.44 | -0.68 |
| higd1b | -0.43 | -0.67 |
| AF347015.33 | -0.43 | -0.63 |
| COPZ2 | -0.42 | -0.63 |
| AF347015.8 | -0.42 | -0.65 |
| AC021016.1 | -0.42 | -0.66 |
| mt-cyb | -0.42 | -0.63 |
| AF347015.2 | -0.42 | -0.64 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 8652557 | |
| 去：0008353 | RNA聚合酶亚基激酶活性 | 塔斯 | 7533895 | |
| GO：0016251 | 一般RNA聚合酶II转录因子活性 | 塔斯 | 9118947 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000079 | 调节细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性 | 塔斯 | 7533895 | |
| 去：0000718 | 核苷酸拆卸，DNA损伤去除 | 经验 | 10583946 | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006367 | RNA聚合酶II启动子的转录启动 | 经验 | 8946909 | |
| 去：0006368 | RNA聚合酶II启动子的RNA伸长率 | 经验 | 9405375 | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006281 | DNA修复 | 塔斯 | 9118947 | |
| GO：0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 | 艾达 | 8692841 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005654 | 核质 | 经验 | 1939271|2449431|8946909 |9512541|9582279 |9790902|10214908 |11313499|12393749 |12646563 |
|
| 去：0005675 | Holo Tfiih综合体 | 塔斯 | 9118947 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ar | AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM | 雄激素受体 | - | HPRD，Biogrid | 10734072|11266437 |
| atf7ip | FLJ10139 |FLJ10688 |MCAF |P621 | 激活转录因子7相互作用蛋白 | - | HPRD | 10777215 |
| CCNH | cak |p34 |p37 | 细胞周期蛋白h | - | HPRD，Biogrid | 7533895 |
| CDK7 | cak1 |CDKN7 |mo15 |STK1 |P39MO15 | 细胞周期蛋白依赖性激酶7 | - | HPRD，Biogrid | 9130708 |
| E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F转录因子1 | - | HPRD，Biogrid | 10428966 |
| ERCC2 | COFS2 |em9 |MGC102762 |MGC126218 |MGC126219 |TTD |XPD | 切除修复交叉补充的啮齿动物修复缺陷，互补组2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 8152490|9130708 |
| ERCC3 | BTF2 |GTF2H |rad25 |tfiih |XPB | 切除修复交叉补充的啮齿动物修复缺陷，互补组3（Xeroderma色素组B组补充） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 9118947|9130708 |15220921 |
| ERCC3 | BTF2 |GTF2H |rad25 |tfiih |XPB | 切除修复交叉补充的啮齿动物修复缺陷，互补组3（Xeroderma色素组B组补充） | - | HPRD | 8194528|9118947 |
| ERCC5 | COFS3 |ERCM2 |uvdr |XPG |XPGC | 切除修复交叉补充的啮齿动物修复缺陷，互补组5 | - | HPRD | 8652557 |
| ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | - | HPRD，Biogrid | 10949034 |
| FUBP1 | FBP |fubp | 上游元素（保险丝）结合蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 11239393 |
| GTF2E1 | fe |TF2E1 |tfiie-a | 通用转录因子IIE，多肽1，α56KDA | - | HPRD | 11113176 |
| hnrnpu | hnrpu |SAF-A |U21.1 | 异质核核糖核蛋白U（支架附着因子A） | - | HPRD | 10490622 |
| KIAA1128 | FLJ14262 |FLJ25809 |GCAP14 |BA486O22.1 | KIAA1128 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| kif13a | FLJ27232 |BA500C11.2 | 动机家庭成员13A | - | HPRD | 10777215 |
| MMS19 | FLJ34167 |FLJ95146 |Met18 |MGC99604 |MMS19L |HMMS19 | MMS19核苷酸切除修复同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD | 11071939 |
| PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C，伽马1 | - | HPRD | 10467411 |
| polr2a | MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 | 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽A，220KDA | - | HPRD | 9710619 |
| PSMC2 | MGC3004 |MSS1 |NBLA10058 |S7 | 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，2 | - | HPRD，Biogrid | 11118327 |
| TCEA1 | GTF2S |sii |TCEA |TF2S |tfiis | 转录伸长因子A（SII），1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922|9765293 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD，Biogrid | 7935417 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg基础转录因子 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG核苷酸切除修复 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录终止 | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol II转录 | 105 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA封盖 | 30 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录耦合ner tc ner | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA POL II转录启动和启动子开口 | 41 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组核苷酸切除修复 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RNA Pol II伸长复合物的反应组形成 | 45 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 转录耦合NER TC NER修复复合物的反应组形成 | 30 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol II前转录事件 | 61 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome全球基因组NER GG NER | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GG NER中切口复合物的反应组形成 | 23 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HIV1早期伸长复合物的反应组形成 | 34 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录启动 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王HCP前列腺癌 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肥胖症的纳德勒高血糖 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Takao对UVB辐射DN的响应 | 98 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杰克逊DNMT1靶向 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee转移和替代剪接DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼（Hoffmann | 75 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ikeda mir30目标 | 116 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-10 | 451 | 458 | 1A，M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
| HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
| mir-148/152 | 668 | 675 | 1A，M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-19 | 153 | 159 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| mir-30-5p | 300 | 306 | M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-330 | 834 | 841 | 1A，M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-363 | 794 | 800 | 1a | HSA-MIR-363 | auugcacgguauccaucuguaa |
| mir-378 | 316 | 322 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |