概括
基因 2969
象征 gtf2i
同义词 bap135 | btkap1 | diws | gtfii-i | ib291 | spin | tfii-i | wbs | wbscr6
描述 一般转录因子III
参考 MIM:601679|HGNC:HGNC:4659|ENSEMBL:ENSG00000263001|HPRD:03399|Vega:Otthumg00000156237
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q11.23
Pascal P值 0.005

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:1.4695

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 nas 9334314
去:0005515 蛋白质结合 IPI 9012831|15231747|17353931
GO:0016251 一般RNA聚合酶II转录因子活性 塔斯 9334314
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006367 RNA聚合酶II启动子的转录启动 塔斯 9334314
去:0006350 转录 IEA -
去:0007165 信号转导 塔斯 9012831
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 来源 PubMed ID
AOF2 BHC110 |KDM1 |KIAA0601 |LSD1 胺氧化酶(含黄素)结构域2 亲和力捕获ms
亲和力捕获 - 韦斯特恩
Biogrid 12493763
ATF6 ATF6A 激活转录因子6 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11287625
btk AGMX1 |在|ATK |bpk |IMD1 |MGC126261 |MGC126262 |PSCTK1 |XLA 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 - HPRD,Biogrid 9012831|10373551
|14623887
HDAC1 DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12393887
HDAC2 RPD3 |yaf1 组蛋白脱乙酰基酶2 亲和力捕获ms
亲和力捕获 - 韦斯特恩
Biogrid 12393887|12493763
HDAC3 HD3 |RPD3 |RPD3-2 组蛋白脱乙酰基酶3 HDAC3与TFII-I相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的HDAC3和TFII-I同工型之间的相互作用进行建模的。 绑定 12239342
HDAC3 HD3 |RPD3 |RPD3-2 组蛋白脱乙酰基酶3 - HPRD,Biogrid 12239342|12393887
HDAC3 HD3 |RPD3 |RPD3-2 组蛋白脱乙酰基酶3 - HPRD 12393887
LSM8 YJR022W LSM8同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) - HPRD,Biogrid 15231747
MAPK3 ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 - HPRD,Biogrid 10648599
我的C Bhlhe39 |c-myc V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物(禽类) - HPRD,Biogrid 8377829
NFKB2 Lyt-10 |Lyt10 B细胞2(P49/P100)中Kappa光多肽基因增强子的核因子 - HPRD 14743216
PHF21A BHC80 |BM-006 |KIAA1696 PhD手指蛋白21A 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12493763
prkg1 CGKI |DKFZP686K042 |FLJ36117 |MGC71944 |PGK |PKG |prkg1b |prkgr1b |cgki-beta |CGKI-ALPHA 蛋白激酶,CGMP依赖性,I型 - HPRD,Biogrid 12082086
PRRX1 phox1 |PMX1 |PRX1 配对相关的同型盒1 - HPRD,Biogrid 9334314
PTP4A3 prl-3 |prl-r |PRL3 蛋白酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员3 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
SRF MCM1 血清反应因子(C-FOS血清响应元件结合转录因子) - HPRD,Biogrid 9334314
Stat1 DKFZP686B04100 |ISGF-3 |Stat91 转录1,91KDA的信号换能器和激活剂 - HPRD,Biogrid 9584171
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD,Biogrid 9584171
USF1 fchl |FCHL1 |hyplip1 |MLTF |mltfi |uef |BHLHB11 上游转录因子1 - HPRD,Biogrid 1961251|9384587 | 9384587
yy1 delta |INO80S |NF-E1 |UCRBP |阴阳1 YY1转录因子 - HPRD 11287625
ZBTB17 Miz-1 |Znf151 |Znf60 |PHZ-67 锌指和包含17的BTB结构域 - HPRD 12193603


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg基础转录因子 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hemin的addya红斑分化 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS DN 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5靶向 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S2 115 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1103 1109 1a HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-27 158 164 1a HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-381 82 89 1A,M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu