基因页:gtf2i
概括?
基因 | 2969 |
象征 | gtf2i |
同义词 | bap135 | btkap1 | diws | gtfii-i | ib291 | spin | tfii-i | wbs | wbscr6 |
描述 | 一般转录因子III |
参考 | MIM:601679|HGNC:HGNC:4659|ENSEMBL:ENSG00000263001|HPRD:03399|Vega:Otthumg00000156237 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q11.23 |
Pascal P值 | 0.005 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GTF2I_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | nas | 9334314 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9012831|15231747|17353931 |
|
GO:0016251 | 一般RNA聚合酶II转录因子活性 | 塔斯 | 9334314 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006367 | RNA聚合酶II启动子的转录启动 | 塔斯 | 9334314 | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9012831 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AOF2 | BHC110 |KDM1 |KIAA0601 |LSD1 | 胺氧化酶(含黄素)结构域2 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 12493763 |
ATF6 | ATF6A | 激活转录因子6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11287625 |
btk | AGMX1 |在|ATK |bpk |IMD1 |MGC126261 |MGC126262 |PSCTK1 |XLA | 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 | - | HPRD,Biogrid | 9012831|10373551 |14623887 |
HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12393887 |
HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 12393887|12493763 |
HDAC3 | HD3 |RPD3 |RPD3-2 | 组蛋白脱乙酰基酶3 | HDAC3与TFII-I相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的HDAC3和TFII-I同工型之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12239342 |
HDAC3 | HD3 |RPD3 |RPD3-2 | 组蛋白脱乙酰基酶3 | - | HPRD,Biogrid | 12239342|12393887 |
HDAC3 | HD3 |RPD3 |RPD3-2 | 组蛋白脱乙酰基酶3 | - | HPRD | 12393887 |
LSM8 | YJR022W | LSM8同源物,U6小核RNA相关(酿酒酵母) | - | HPRD,Biogrid | 15231747 |
MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | - | HPRD,Biogrid | 10648599 |
我的C | Bhlhe39 |c-myc | V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物(禽类) | - | HPRD,Biogrid | 8377829 |
NFKB2 | Lyt-10 |Lyt10 | B细胞2(P49/P100)中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | - | HPRD | 14743216 |
PHF21A | BHC80 |BM-006 |KIAA1696 | PhD手指蛋白21A | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12493763 |
prkg1 | CGKI |DKFZP686K042 |FLJ36117 |MGC71944 |PGK |PKG |prkg1b |prkgr1b |cgki-beta |CGKI-ALPHA | 蛋白激酶,CGMP依赖性,I型 | - | HPRD,Biogrid | 12082086 |
PRRX1 | phox1 |PMX1 |PRX1 | 配对相关的同型盒1 | - | HPRD,Biogrid | 9334314 |
PTP4A3 | prl-3 |prl-r |PRL3 | 蛋白酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
SRF | MCM1 | 血清反应因子(C-FOS血清响应元件结合转录因子) | - | HPRD,Biogrid | 9334314 |
Stat1 | DKFZP686B04100 |ISGF-3 |Stat91 | 转录1,91KDA的信号换能器和激活剂 | - | HPRD,Biogrid | 9584171 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | - | HPRD,Biogrid | 9584171 |
USF1 | fchl |FCHL1 |hyplip1 |MLTF |mltfi |uef |BHLHB11 | 上游转录因子1 | - | HPRD,Biogrid | 1961251|9384587 | 9384587 |
yy1 | delta |INO80S |NF-E1 |UCRBP |阴阳1 | YY1转录因子 | - | HPRD | 11287625 |
ZBTB17 | Miz-1 |Znf151 |Znf60 |PHZ-67 | 锌指和包含17的BTB结构域 | - | HPRD | 12193603 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg基础转录因子 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hemin的addya红斑分化 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nemeth炎症反应LPS DN | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delpuech FOXO3靶向 | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1103 | 1109 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-27 | 158 | 164 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-381 | 82 | 89 | 1A,M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |