基因页:GUCY1B2
概括?
基因 | 2974 |
象征 | GUCY1B2 |
同义词 | GC-SB2 |
描述 | 鸟苷酸环化酶1,可溶性,β2(假元) |
参考 | MIM:603695|HGNC:HGNC:4686|ENSEMBL:ENSG00000123201|HPRD:07542| |
基因类型 | 伪 |
地图位置 | 13Q14.3 |
Pascal P值 | 0.258 |
胎儿β | 0.386 |
主持人 | 尾状基底神经节 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1475447 | 13 | 51631607 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 2.754e-8 | 0 | 23391 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4942946 | 13 | 51634480 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 5.91e-11 | 0 | 20518 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6561609 | 13 | 51638146 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 5.686e-11 | 0 | 16852 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6561610 | 13 | 51638170 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 5.686e-11 | 0 | 16828 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6561611 | 13 | 51638235 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 3.91E-8 | 0 | 16763 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9596435 | 13 | 51641473 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 1.054e-8 | 0 | 13525 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7337587 | 13 | 51642242 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 5.874e-11 | 0 | 12756 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7338712 | 13 | 51642303 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 2.298E-9 | 0 | 12695 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12869642 | 13 | 51642548 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 2.177E-6 | 0 | 12450 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17593235 | 13 | 51642595 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 8.872E-8 | 0 | 12403 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17593270 | 13 | 51642668 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 2.206E-7 | 0 | 12330 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17593291 | 13 | 51642699 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 8.891E-8 | 0 | 12299 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12870315 | 13 | 51642708 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 1.021E-12 | 0 | 12290 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12870383 | 13 | 51642931 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 1.021E-12 | 0 | 12067 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1328358 | 13 | 51643053 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 2.065E-6 | 0 | 11945 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7325888 | 13 | 51643678 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 1.114e-12 | 0 | 11320 | gtex_brain_putamen_basal |
RS55865930 | 13 | 51644476 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 1.202E-7 | 0 | 10522 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4605050 | 13 | 51645674 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 3.627e-12 | 0 | 9324 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9563016 | 13 | 51646895 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 3.01E-6 | 0 | 8103 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9535567 | 13 | 51648632 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 4.741E-10 | 0 | 6366 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9535573 | 13 | 51655576 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 9.966e-11 | 0 | -578 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7336329 | 13 | 51663251 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 3.092E-10 | 0 | -8253 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9535575 | 13 | 51668648 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 2.243e-11 | 0 | -13650 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7328201 | 13 | 51674307 | GUCY1B2 | ENSG00000123201.10 | 8.993E-8 | 0 | -19309 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GUCY1B2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |