基因页:ZDHHC8
概括?
基因 | 29801 |
象征 | ZDHHC8 |
同义词 | DHHC8 | ZDHHCL1 | ZNF378 |
描述 | 锌指DHHC型包含8个 |
参考 | MIM:608784|HGNC:HGNC:18474|ENSEMBL:ENSG0000000099904|HPRD:12298|Vega:Otthumg00000150499 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q11.21 |
Pascal P值 | 9.066e-5 |
Sherlock P值 | 0.122 |
胎儿β | -0.181 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZDHHC8_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008415 | 酰基转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - | |
去:0030659 | 细胞质囊泡膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN | 20 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
营地结肠癌复制号码 | 92 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 703 | 709 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-133 | 35 | 41 | M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
mir-218 | 959 | 965 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu | ||||
mir-335 | 722 | 728 | M8 | HSA-MIR-335脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU |