概括
基因 29801
象征 ZDHHC8
同义词 DHHC8 | ZDHHCL1 | ZNF378
描述 锌指DHHC型包含8个
参考 MIM:608784|HGNC:HGNC:18474|ENSEMBL:ENSG0000000099904|HPRD:12298|Vega:Otthumg00000150499
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.21
Pascal P值 9.066e-5
Sherlock P值 0.122
胎儿β -0.181

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008415 酰基转移酶活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -
去:0030659 细胞质囊泡膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN 20 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
营地结肠癌复制号码 92 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
boudoukha由IGF2BP2绑定 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 703 709 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-133 35 41 M8 HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-218 959 965 M8 HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-335 722 728 M8 HSA-MIR-335 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU