基因页面:STRN4
总结吗?
| GeneID | 29888年 |
| 象征 | STRN4 |
| 同义词 | 寻| zinedin |
| 描述 | striatin 4 |
| 参考 | MIM: 614767|HGNC: HGNC: 15721|运用:ENSG00000090372|HPRD: 18125|织女:OTTHUMG00000183432 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 q13.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.212 |
| 夏洛克假定值 | 0.32 |
| 胎儿β | 0.006 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 3 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 3 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0631 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg12254611 | 19 | 47249193 | STRN4; FKRP | 3.448的军医 | -0.233 | 0.041 | DMG: Wockner_2014 |
| cg06095560 | 19 | 47633912 | STRN4 | 0.001 | 3.687 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg11822964 | 19 | 47129337 | STRN4 | 5.988的军医 | -3.649 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs36781 | chr5 | 109289728 | STRN4 | 29888年 | 0.14 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005516 | 钙调蛋白结合 | 助教 | 10748158 | |
| 去:0005198 | 结构分子活动 | 助教 | 10748158 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 10748158 |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 10748158 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005624 | 膜分数 | 助教 | 10748158 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 助教 | 10748158 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AK5 | AK6 | MGC33326 | 腺苷酸激酶5 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| asn | TS11 | 天冬酰胺合成酶 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| BAT1 | D6S81E | DDX39B | UAP56 | HLA-B相关记录1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| CAV1 | 骑兵| MSTP085 | VIP21 | 1、窖蛋白的小窝蛋白22 kda | - - - - - - | HPRD | 11707266 |
| CLDN12 | - - - - - - | claudin 12 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| CTTNBP2 | C7orf8 | CORTBP2 | FLJ34229 | KIAA1758 | MGC104579 | Orf4 | cortactin结合蛋白2 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| CTTNBP2NL | DKFZp547A023 | FLJ13278 | CTTNBP2 n端像 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| ECSIT | SITPEC | ECSIT同族体(果蝇) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| FAM40A | FLJ14743 | KIAA1761 | MGC148091 | rp4 - 773 n10.1 | 家庭使用序列相似性40岁的成员 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| GDF9 | - - - - - - | 生长分化因子9 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| KLHDC2 | HCLP-1 |连结控制协定 | kelch域包含2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| 世纪挑战集团 | DKFZp762O1615 | FLJ38893 | FLJ46755 | MCC1 | 突变在结肠直肠癌 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| MOBKL3 | 2 c4d | cgi - 95 | MGC12264 | MOB1 | MOB3 | PREI3 | MOB1,议员们一个活页夹激酶activator-like 3(酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| MTG1 | 三磷酸鸟苷| GTPBP7 | rp11 - 108 k14.2 | 线粒体GTPase 1同族体(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NBEA | BCL8B | LYST2 | neurobeachin | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| PDCD10 | CCM3 | MGC1212 | MGC24477 | TFAR15 | 程序性细胞死亡10 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PI4KA | FLJ16556 | PI4K-ALPHA | PIK4CA | pi4K230 | 磷脂酰肌醇4-kinase、催化α | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| PPP2CA | PP2Ac | PP2CA | RP-C | 蛋白磷酸酶2(原2 a),催化亚基、α同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2CB | PP2CB | 蛋白磷酸酶2(原2 a),催化亚基,β同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2R1A | MGC786 | PR65A | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,α同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| rp5 - 1000 e10.4 | DKFZp686A0768 | FLJ21168 |沟渠 | 抑制IKK的ε | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| rp6 - 213 h19.1 | 面具| MST4 | 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶MST4 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| SLC25A6 | AAC3 | ANT3 | ANT3Y | MGC17525 | 溶质载体家族25(线粒体载体;腺嘌呤核苷转运蛋白),成员6 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| STK24 | MST-3 | MST3 | MST3B | STE20 | STK3 | 丝氨酸/苏氨酸激酶24 (STE20同族体、酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931|18782753 |
| STK25 | DKFZp686J1430 | SOK1 | YSK1 | 丝氨酸/苏氨酸激酶25 (STE20同族体、酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| STRN | MGC125642 | SG2NA | striatin,钙调蛋白结合蛋白 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| STRN3 | SG2NA | striatin,钙调蛋白结合蛋白3 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| TRAF3IP3 | DJ434O14.3 | FLJ44151 | MGC117354 | MGC163289 | T3JAM | TRAF3相互作用蛋白3 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 加里CD5目标了 | 473年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标8小时 | 164年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 祖奇转移DN | 44 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AGUIRRE胰腺癌拷贝数 | 298年 | 174年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌生存A6差 | 456年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群6 DN | 38 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 128 | 691年 | 697年 | m8 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| miR-23 | 837年 | 843年 | 1 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-29 | 130年 | 137年 | 1、m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 377 | 694年 | 700年 | m8 | hsa - mir - 377 | AUCACACAAAGGCAACUUUUGU |
| mir - 485 - 5 - p | 75年 | 81年 | m8 | hsa - mir - 485 - 5 - p | AGAGGCUGGCCGUGAUGAAUUC |