基因页:EEF2K
概括?
基因 | 29904 |
象征 | EEF2K |
同义词 | HSU93850 | EEF-2K |
描述 | 真核伸长因子2激酶 |
参考 | MIM:606968|HGNC:HGNC:24615|ENSEMBL:ENSG00000103319|HPRD:07369|Vega:Otthumg0000000094771 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p12.2 |
Pascal P值 | 0.075 |
Sherlock P值 | 0.077 |
胎儿β | -0.233 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
EEF2K | CHR16 | 22269932 | G | 一个 | NM_013302 | p.383e> k | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS929837 | CHR16 | 22172607 | EEF2K | 29904 | 0.12 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EEF2K_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
去:0004686 | 伸长因子-2激酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008135 | 翻译因子活性,核酸结合 | 塔斯 | 9144159 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006414 | 翻译伸长 | 塔斯 | 9144159 | |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 15809305 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 9144159 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta EIF途径 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST ERK1 ERK2 MAPK途径 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST P38 MAPK途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P38伽马三角洲途径 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PKB介导的事件 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome MTORC1介导的信号传导 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂红色DN的反应 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN | 60 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1064 | 1070 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-196 | 1063 | 1069 | M8 | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
mir-330 | 1685年 | 1692年 | 1A,M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-34/449 | 11 | 17 | M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc |