概括
基因 29904
象征 EEF2K
同义词 HSU93850 | EEF-2K
描述 真核伸长因子2激酶
参考 MIM:606968|HGNC:HGNC:24615|ENSEMBL:ENSG00000103319|HPRD:07369|Vega:Otthumg0000000094771
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p12.2
Pascal P值 0.075
Sherlock P值 0.077
胎儿β -0.233
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
EEF2K CHR16 22269932 G 一个 NM_013302 p.383e> k 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS929837 CHR16 22172607 EEF2K 29904 0.12 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005516 钙调蛋白结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
去:0004686 伸长因子-2激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008135 翻译因子活性,核酸结合 塔斯 9144159
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006414 翻译伸长 塔斯 9144159
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 15809305
去:0005737 细胞质 塔斯 9144159

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta EIF途径 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST ERK1 ERK2 MAPK途径 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST P38 MAPK途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P38伽马三角洲途径 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKB介导的事件 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MTORC1介导的信号传导 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂红色DN的反应 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 1064 1070 M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-196 1063 1069 M8 HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-330 1685年 1692年 1A,M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-34/449 11 17 M8 HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc