基因页:DSE
概括?
基因 | 29940 |
象征 | DSE |
同义词 | dsep | dsepi | edsmc2 | sart-2 | sart2 |
描述 | 皮肤硫酸盐分配酶 |
参考 | MIM:605942|HGNC:HGNC:21144|ENSEMBL:ENSG00000111817|HPRD:05807| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q22 |
Pascal P值 | 0.273 |
Sherlock P值 | 0.282 |
胎儿β | 0.401 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DSE_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016853 | 异构酶活性 | IEA | - | |
GO:0047757 | 软骨素 - 葡萄糖酸葡萄糖酸5-二聚酶活性 | 艾达 | 16505484 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0030208 | 皮肤硫酸盐生物合成过程 | 艾达 | 16505484 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 10679095 | |
去:0005783 | 内质网 | 艾达 | 10679095 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖胺聚糖生物合成软骨素硫酸盐 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨乳腺癌ESR1散装DN | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU细胞迁移 | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yague pryumor耐药性DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标1 DN | 63 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 1小时信号传导 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-9 | 831 | 838 | 1A,M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |